RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000496183.5

RBM39-241, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 632 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-241ENST00000496183 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 TRAK1Q9UPV9 953 aa8.62□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PP55 124 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP8.61□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.61□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 SEMA6BQ9H3T3 888 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 NPHS2Q9NP85 383 aa8.61□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 TMC7Q7Z402 723 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 CCNJLQ8IV13 435 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.6□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 A0A096LPE4 126 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 A0A1W2PPZ6 126 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 PLCB3Q01970 1234 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 UVSSAQ2YD98 709 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 KLHDC7BQ96G42 594 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 RNF208Q9H0X6 261 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 NISCHQ9Y2I1 1504 aa8.59□□□□□ -1.03
RBM39-241ENST00000496183 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 DYRK3O43781 588 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 NLRP12P59046 1061 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 AEBP1Q8IUX7 1158 aa8.58□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ATP2B2Q01814 1243 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ANKRD34AQ69YU3 496 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 FDX2Q6P4F2 183 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 Q6ZS46 218 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 TREHO43280 583 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ALX3O95076 343 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 CYP11A1P05108 521 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 PCDH1Q08174 1060 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ASB16Q96NS5 453 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 TCF12Q99081 682 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 USP26Q9BXU7 913 aa8.56□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 METTL12A8MUP2 240 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 IGHA2P01877 340 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 FGD1P98174 961 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 GSTM4Q03013 218 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 FBF1Q8TES7 1133 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 CYP4F12Q9HCS2 524 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 KCNK4Q9NYG8 393 aa8.55□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ADAM11O75078 769 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 WISP1O95388 367 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 XRCC5P13010 732 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 GRIA4P48058 902 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 NUTM2GQ5VZR2 741 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 UBASH3BQ8TF42 649 aa8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP8.54□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 GSC2O15499 205 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ITPKAP23677 461 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 MAPK8P45983 427 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 XP32Q5T750 250 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 PRR23CQ6ZRP0 262 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 SLC51AQ86UW1 340 aa8.53□□□□□ -1.04
RBM39-241ENST00000496183 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 GAS2O43903 313 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 DSC3Q14574 896 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 SPRED3Q2MJR0 410 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 DTHD1Q6ZMT9 781 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 ZNF576Q9H609 170 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 HIF3AQ9Y2N7 669 aa8.52□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 MEGF11A6BM72 1044 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 TM4SF5O14894 197 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 AP3B2Q13367 1082 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 CORO1BQ9BR76 489 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 ABCB6Q9NP58 842 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 RAXQ9Y2V3 346 aa8.51□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 B3GALT4O96024 378 aa8.5□□□□□ -1.05
RBM39-241ENST00000496183 PPP2R3AQ06190 1150 aa8.5□□□□□ -1.05
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