RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495293.5

RBM39-240, Transcript of RNA binding motif protein 39, human

TSL 2

Gene RBM39, Length 759 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM39-240	ENST00000495293	C1orf127	Q8N9H9	656 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	KRTAP4-7	Q9BYR0	210 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	CHRD	Q9H2X0	955 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	SALL4	Q9UJQ4	1053 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	EEA1	Q15075	1411 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	FSCN2	O14926	492 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	MTMR3	Q13615	1198 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	FAM9A	Q8IZU1	332 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	ABTB2	Q8N961	1025 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	EDEM1	Q92611	657 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	KLHDC7B	Q96G42	594 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	FAM13B	Q9NYF5	915 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	SERPINA10	Q9UK55	444 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	7.27	□□□□□ -1.24
RBM39-240	ENST00000495293	SMNDC1	O75940	238 aa	Known RBP eCLIP	7.27	□□□□□ -1.25	8e-11	■■■■■ 32.4
RBM39-240	ENST00000495293	SSTR4	P31391	388 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	CD97	P48960	835 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	PDE12	Q6L8Q7	609 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	NCAPG2	Q86XI2	1143 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	HOMEZ	Q8IX15	550 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	SPACA7	Q96KW9	195 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	ADAM19	Q9H013	955 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	MUC3B	Q9H195	1237 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	ARAP1	Q96P48	1450 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	TGFB1	P01137	390 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	PDGFA	P04085	211 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	MPST	P25325	297 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	ZNF438	Q7Z4V0	828 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	CACTIN-AS1	Q8N1I8	211 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	FAM46A	Q96IP4	442 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	RAX	Q9Y2V3	346 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	SHROOM2	Q13796	1616 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	CARNS1	A5YM72	827 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	ADAMTS4	O75173	837 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	DNM1	Q05193	864 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	EIF1AX	P47813	144 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	LCE1D	Q5T752	114 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	XKR5	Q6UX68	686 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	IQGAP2	Q13576	1575 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	HMX2	A2RU54	273 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	IGLV1-40	P01703	118 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	ZDHHC13	Q8IUH4	622 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	TRIM42	Q8IWZ5	723 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	ARID3A	Q99856	593 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	C7orf69	Q9H7B7	122 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	SOX13	Q9UN79	622 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	PRX	Q9BXM0	1461 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293		H3BRJ5	948 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	PTPRA	P18433	802 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	PREP	P48147	710 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	NLRP12	P59046	1061 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	DUOXA2	Q1HG44	320 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	UTP4	Q969X6	686 aa	Known RBP	7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	SEC31B	Q9NQW1	1179 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	STOML1	Q9UBI4	398 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	POLI	Q9UNA4	740 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	CTTNBP2	Q8WZ74	1663 aa		7.22	□□□□□ -1.25
RBM39-240	ENST00000495293	EREG	O14944	169 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	CES1	P23141	567 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	SSFA2	P28290	1259 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	NFIA	Q12857	509 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	C8orf34	Q49A92	452 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	NOM1	Q5C9Z4	860 aa	Known RBP	7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	MYRFL	Q96LU7	910 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		7.21	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	PTPRG	P23470	1445 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	GOLGA3	Q08378	1498 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	PRR19	A6NJB7	356 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	KIAA1324L	A8MWY0	1029 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	PDE2A	O00408	941 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	DHX15	O43143	795 aa	Known RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	VN1R5	Q7Z5H4	357 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	SLC7A3	Q8WY07	619 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	CEP41	Q9BYV8	373 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	LATS2	Q9NRM7	1088 aa		7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	FOXD3	Q9UJU5	478 aa	Predicted RBP	7.2	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	DLGAP3	O95886	979 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	MZF1	P28698	734 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	RANGAP1	P46060	587 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	FAM20C	Q8IXL6	584 aa		7.19	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	UGGT2	Q9NYU1	1516 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	FZD6	O60353	706 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	TNFRSF21	O75509	655 aa		7.18	□□□□□ -1.26
RBM39-240	ENST00000495293	NPR3	P17342	541 aa		7.18	□□□□□ -1.26

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