RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422987.3

LRRN3-203, Transcript of leucine rich repeat neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRN3, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRN3-203ENST00000422987 EVCP57679 992 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 NUCB2P80303 420 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 RASGRF1Q13972 1273 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 NEUROD6Q96NK8 337 aa4.6□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 ERVV-1B6SEH8 477 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 EXOC5O00471 708 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 PDE8BO95263 885 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 FGAP02671 866 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 LIG1P18858 919 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 APOBRQ0VD83 1088 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 RESTQ13127 1097 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 TBC1D9BQ66K14 1250 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 CCDC24Q8N4L8 307 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 PPP1R9BQ96SB3 815 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 HMG20BQ9P0W2 317 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 A0A087WWV3 80 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 PRKAB2O43741 272 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 ERFEQ4G0M1 354 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 CCDC102BQ68D86 513 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 TXNRD3Q86VQ6 643 aa4.59□□□□□ -1.67
LRRN3-203ENST00000422987 KIF28PB7ZC32 967 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 ADD2P35612 726 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 ATP6V1AP38606 617 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 MCM2P49736 904 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 BCAMP50895 628 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 GRIK5Q16478 980 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 FERMT3Q86UX7 667 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 FBXL16Q8N461 479 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 GOLPH3LQ9H4A5 285 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CARMIL3Q8ND23 1372 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 RTL9Q8NET4 1388 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 NAV1Q8NEY1 1877 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 ZNF804BA4D1E1 1349 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 SCN9AQ15858 1988 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 HAND2P61296 217 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 DDB1Q16531 1140 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CERKQ8TCT0 537 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 AIFM3Q96NN9 605 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 GBP4Q96PP9 640 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 DSCC1Q9BVC3 393 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 HELLSQ9NRZ9 838 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CCDC87Q9NVE4 849 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 THRAP3Q9Y2W1 955 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CEP350Q5VT06 3117 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 FAM177BA6PVY3 158 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CDC27P30260 824 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 BRF1Q92994 677 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 NEK1Q96PY6 1258 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CHMP4AQ9BY43 222 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 UBAP1LF5GYI3 381 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 HAX1O00165 279 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 RANBP6O60518 1105 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 PDE8AO60658 829 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 PFKFB2O60825 505 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 STARD3NLO95772 234 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 VPS72Q15906 364 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 LRSAM1Q6UWE0 723 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 PROM2Q8N271 834 aa4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 ZNF532Q9HCE3 1301 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 MYH1P12882 1939 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 GSG1L2A8MUP6 293 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 GPAA1O43292 621 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 MRE11P49959 708 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 NTRK3Q16288 839 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 ATP2B3Q16720 1220 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 GREB1LQ9C091 1923 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 WNT7AO00755 349 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 PDE6AP16499 860 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 MCCP23508 829 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 HSPA1LP34931 641 aa4.57□□□□□ -1.68
LRRN3-203ENST00000422987 CCT2P78371 535 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.7 ms