RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409212.5

SH3BP4-203, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,231 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-203ENST00000409212 TIMM10P62072 90 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 FERMT2Q96AC1 680 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 DHX58Q96C10 678 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 BICD1Q96G01 975 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 PRIMPOLQ96LW4 560 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 SPDYE3A6NKU9 549 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 PDE8AO60658 829 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 MBD4O95243 580 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.09■□□□□ 0.496e-7■□□□□ 8.6
SH3BP4-203ENST00000409212 AOPEPQ8N6M6 819 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 KAT6BQ8WYB5 2073 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 PTPRTO14522 1441 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 GNPATO15228 680 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 ITGA6P23229 1130 aa18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP18.09■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 MYZAPP0CAP1 466 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 KRT13P13646 458 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 TBC1D5Q92609 795 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 SKILP12757 684 aa18.08■□□□□ 0.49
SH3BP4-203ENST00000409212 SPECC1Q5M775 1068 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 TMX1Q9H3N1 280 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 LGR6Q9HBX8 967 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 JADE2Q9NQC1 790 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 TYRO3Q06418 890 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC186Q7Z3E2 898 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 GOPCQ9HD26 462 aa18.08■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 LMTK3Q96Q04 1460 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM87BQ96K49 555 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 PRPF4BQ13523 1007 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 ARHGEF10O15013 1369 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 PLVAPQ9BX97 442 aa18.07■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 B4DLN1 442 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 CNBD1Q8NA66 436 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 SYT1P21579 422 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 TNNI2P48788 182 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 JDP2Q8WYK2 163 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 APPBP2Q92624 585 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 USP19O94966 1318 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 TUBB4AP04350 444 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 RPS6KB1P23443 525 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 VEZTQ9HBM0 779 aa18.06■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 TMEM2Q9UHN6 1383 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 IQUBQ8NA54 791 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 BICDL2A1A5D9 508 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 CKAP4Q07065 602 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 DTHD1Q6ZMT9 781 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 KIAA0232Q92628 1395 aa18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP18.05■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 XAGE2Q96GT9 111 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 GCKRQ14397 625 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 NEO1Q92859 1461 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 RIMBP2O15034 1052 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 SEC24BO95487 1268 aa18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP18.04■□□□□ 0.481e-10■■■■■ 44.1
SH3BP4-203ENST00000409212 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP18.04■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 SGSM2O43147 1006 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 A1BGP04217 495 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 POLD1P28340 1107 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 TEX11Q8IYF3 940 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 SLC27A2O14975 620 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 KBTBD3Q8NAB2 608 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 CERS3Q8IU89 383 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 MMRN2Q9H8L6 949 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 ERICH4A6NGS2 130 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 NBPF14Q5TI25 921 aa18.03■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 SUCLG2Q96I99 432 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 KIF24Q5T7B8 1368 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 MCM7P33993 719 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 HS2ST1Q7LGA3 356 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 GOLGA6L10A0A0M3HER8 536 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 RXRAP19793 462 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 FERMT1Q9BQL6 677 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 CCDC87Q9NVE4 849 aa18.02■□□□□ 0.48
SH3BP4-203ENST00000409212 NF2P35240 595 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4-203ENST00000409212 ACTN2P35609 894 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4-203ENST00000409212 LPIN2Q92539 896 aa18.02■□□□□ 0.47
SH3BP4-203ENST00000409212 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-203ENST00000409212 DYNC1I1O14576 645 aa18.01■□□□□ 0.47
SH3BP4-203ENST00000409212 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP18.01■□□□□ 0.47
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