RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392539.3

HOXD13-201, Transcript of homeobox D13, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD13, Length 2,240 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13-201ENST00000392539 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP30.88■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 STRN4Q9NRL3 753 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 CDC25BP30305 580 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 EVA1CP58658 441 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ENGASEQ8NFI3 743 aa30.88■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 PRC1O43663 620 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 HAND2P61296 217 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 SCARF1Q14162 830 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 IQCB1Q15051 598 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP30.87■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 CDHR2Q9BYE9 1310 aa30.87■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 MYH3P11055 1940 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 AKAP11Q9UKA4 1901 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ME1P48163 572 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 SARM1Q6SZW1 724 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 DNAJC10Q8IXB1 793 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 NCOA7Q8NI08 942 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 RTEL1Q9NZ71 1219 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 WDR19Q8NEZ3 1342 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 RIC1Q4ADV7 1423 aa30.86■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ATP2B3Q16720 1220 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 FSIP1Q8NA03 581 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 STARD3NLO95772 234 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.85■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30.84■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa30.84■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ITGB4P16144 1822 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF213O14771 459 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 PPFIA3O75145 1194 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 METTL24Q5JXM2 366 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 C8orf76Q96K31 380 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 ANO10Q9NW15 660 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 CLIP2Q9UDT6 1046 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa30.83■■■□□ 2.53
HOXD13-201ENST00000392539 GPAA1O43292 621 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 NRBP1Q9UHY1 535 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 GOLGA8BA8MQT2 603 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ADALQ6DHV7 355 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP30.82■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ASAP1Q9ULH1 1129 aa30.82■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PQ27 194 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PQ64 194 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 A0A1W2PQD8 194 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 SLAIN2Q9P270 581 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 PCDHA7Q9UN72 937 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 PIGBQ92521 554 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 HPS5Q9UPZ3 1129 aa30.81■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 C4AP0C0L4 1744 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 C4BP0C0L5 1744 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ANTXR2P58335 489 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa30.8■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP30.8■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 BRAPQ7Z569 592 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 TTF1Q15361 905 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 PI16Q6UXB8 463 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 RGS22Q8NE09 1264 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 TTLL11Q8NHH1 800 aa30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP30.79■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 CPLX1O14810 134 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 YEATS4O95619 227 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ITGA6P23229 1130 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 MCAMP43121 646 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 NLRP10Q86W26 655 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 LINC00301Q8NCQ3 95 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 KCNG4Q8TDN1 519 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ATRNO75882 1429 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 BECN2A8MW95 431 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ADD2P35612 726 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 LRMPQ12912 555 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 STK38Q15208 465 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 POLR3EQ9NVU0 708 aa30.78■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 HSPA2P54652 639 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 ZMYND15Q9H091 742 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP30.77■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 GREM2Q9H772 168 aa30.77■■■□□ 2.52
HOXD13-201ENST00000392539 CTSWP56202 376 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 HLFQ16534 295 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 CEP57L1Q8IYX8 460 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 CNNM1Q9NRU3 951 aa30.76■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP30.76■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 TRDNQ13061 729 aa30.75■■■□□ 2.51
HOXD13-201ENST00000392539 SYNE4Q8N205 404 aa30.75■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.7 ms