RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRC27Q9C0I9 530 aa19.64■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 DYNC1I1O14576 645 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 MCM3P25205 808 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 SPAG5Q96R06 1193 aa19.63■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 SLC52A2Q9HAB3 445 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 IFFO1Q0D2I5 559 aa19.63■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 BRAPQ7Z569 592 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 GOPCQ9HD26 462 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CALM1P0DP23 149 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CALM2P0DP24 149 aa19.63■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CALM3P0DP25 149 aa19.63■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 CALML3P27482 149 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 XAGE2Q96GT9 111 aa19.62■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 SH3TC1Q8TE82 1336 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 GOLGA6L7A0A1B0GV03 622 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 PLEKHG3A1L390 1219 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 MCM7P33993 719 aa19.62■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 ERMNQ8TAM6 284 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 DYDC1Q8WWB3 177 aa19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 BCCIPQ9P287 314 aaKnown RBP eCLIP19.61■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 C6orf50Q9HD87 102 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 WWC3Q9ULE0 1092 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 KCNQ3O43525 872 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 LDHBP07195 334 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 TNNI2P48788 182 aa19.61■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa19.6■□□□□ 0.73
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SH3BP4-202ENST00000392011 PLIN2Q99541 437 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 RBSNQ9H1K0 784 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 V9GYY5 206 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT2P35908 639 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 DRC1Q96MC2 740 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 RTL9Q8NET4 1388 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 RIMBP2O15034 1052 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 USP44Q9H0E7 712 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAJC10Q8IXB1 793 aa19.6■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 KBTBD3Q8NAB2 608 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 GPAA1O43292 621 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 OGFOD1Q8N543 542 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 LTKP29376 864 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 APPBP2Q92624 585 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 ARMT1Q9H993 441 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 GNPATO15228 680 aa19.59■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDM1O75626 825 aa19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP10AO60312 1499 aa19.58■□□□□ 0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 SHTN1A0MZ66 631 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 TAF5LO75529 589 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 NEBLO76041 1014 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 AOX1Q06278 1338 aa19.58■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 PLCD4Q9BRC7 762 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 POTEB2H3BUK9 544 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT79Q5XKE5 535 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD2Q9GZV1 360 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM160A1Q05DH4 1040 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa19.57■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 SMARCC2Q8TAQ2 1214 aa19.56■□□□□ 0.72
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SH3BP4-202ENST00000392011 EHBP1Q8NDI1 1231 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 VWA3AA6NCI4 1184 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 PLCG2P16885 1265 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 DTHD1Q6ZMT9 781 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 IQUBQ8NA54 791 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 PDE8AO60658 829 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 ARID5AQ03989 594 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 TRERF1Q96PN7 1200 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC4O15439 1325 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 INSRP06213 1382 aa19.56■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 KIAA0232Q92628 1395 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 CTR9Q6PD62 1173 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC174Q6PII3 467 aa19.55■□□□□ 0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
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