RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000389413.7

PTPRN2-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN2, Length 4,723 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRN2-201ENST00000389413 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
PTPRN2-201ENST00000389413 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP18.46■□□□□ 0.552e-6■□□□□ 10.4
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRN2-201ENST00000389413 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa18.46■□□□□ 0.55
PTPRN2-201ENST00000389413 ABCC3O15438 1527 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 RRAGBQ5VZM2 374 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ELP1O95163 1332 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 KIAA0754O94854 1291 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 LDHCP07864 332 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 RXRAP19793 462 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 APPBP2Q92624 585 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP18.45■□□□□ 0.542e-6■■■□□ 15.2
PTPRN2-201ENST00000389413 MYL5Q02045 173 aa18.45■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CHD1O14646 1710 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 A0A0D9SFI3 127 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CALML4Q96GE6 196 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 LAMC1P11047 1609 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ANO1Q5XXA6 986 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM114A1Q8IWE2 563 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 GTF3C6Q969F1 213 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CENPHQ9H3R5 247 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 BAG3O95817 575 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 PAFAH1B1P43034 410 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 RASEFQ8IZ41 740 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 DHX58Q96C10 678 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 TPCN1Q9ULQ1 816 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF76P36508 570 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 FAM89AQ96GI7 184 aa18.44■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ADAMTS2O95450 1211 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 XAGE2Q96GT9 111 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 SYT10Q6XYQ8 523 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM47Q96LD4 638 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa18.43■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC175P0C221 793 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 TMEM87BQ96K49 555 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 USP6P35125 1406 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 PRR36Q9H6K5 1346 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 SLF2Q8IX21 1173 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 FEZ1Q99689 392 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 KIF20AO95235 890 aa18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP18.42■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CALM1P0DP23 149 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CALM2P0DP24 149 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 CALM3P0DP25 149 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 IDEP14735 1019 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP18.41■□□□□ 0.549e-7■■■■■ 33.9
PTPRN2-201ENST00000389413 RTL9Q8NET4 1388 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 GPAA1O43292 621 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 STAT6P42226 847 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 EHBP1Q8NDI1 1231 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 LIG1P18858 919 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa18.41■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 B4E1Z4 1266 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 MAP4K1Q92918 833 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 SEPT11Q9NVA2 429 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 STX8Q9UNK0 236 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 GNAQP50148 359 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 E7EWF7 191 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 A1BGP04217 495 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.4■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 ROBO2Q9HCK4 1378 aa18.39■□□□□ 0.54
PTPRN2-201ENST00000389413 MBD4O95243 580 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 RDXP35241 583 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 RILPL1Q5EBL4 403 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 ALS2CR12Q96Q35 445 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 VAT1LQ9HCJ6 419 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 KRT2P35908 639 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 ITGA6P23229 1130 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC96Q2M329 555 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.39■□□□□ 0.53
PTPRN2-201ENST00000389413 CCDC178Q5BJE1 867 aa18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 180.8 ms