RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368078.7

CASQ1-201, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CASQ1, Length 1,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-201ENST00000368078 FOXP2O15409 715 aa18.39■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CYP21A2P08686 494 aa18.39■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa18.39■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 MAGEB6Q8N7X4 407 aa18.39■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 IRS2Q9Y4H2 1338 aa18.39■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 HSP90AA1P07900 732 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 BAG6P46379 1132 aa18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 UBE3CQ15386 1083 aa18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TTLL5Q6EMB2 1281 aa18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 DOCK2Q92608 1830 aa18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TTC14Q96N46 770 aa18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 DSCC1Q9BVC3 393 aa18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 GPAA1O43292 621 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 BBOX1O75936 387 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 NBR1Q14596 966 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 RNF20Q5VTR2 975 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TMX3Q96JJ7 454 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CRAMP1Q96RY5 1269 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ABCF2Q9UG63 623 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 SRGNP10124 158 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 DDIT3P35638 169 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 AK2P54819 239 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 MAP3K12Q12852 859 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TM6SF1Q9BZW5 370 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 LRP2BPQ9P2M1 347 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 JAG2Q9Y219 1238 aa18.37■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 XDHP47989 1333 aa18.36■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP18.36■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TSGA10IPQ3SY00 556 aa18.36■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 RUFY3Q7L099 469 aa18.36■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 TCEANC2Q96MN5 208 aa18.36■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 DENND2AQ9ULE3 1009 aa18.36■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.36■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 OLFM4Q6UX06 510 aa18.35■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 PDRG1Q9NUG6 133 aa18.35■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa18.35■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 MYH13Q9UKX3 1938 aa18.35■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 FGAP02671 866 aa18.35■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 STOX1Q6ZVD7 989 aa18.35■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ANP32EQ9BTT0 268 aa18.34■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 POLLQ9UGP5 575 aa18.34■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 PDE6BP35913 854 aa18.33■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 MCM2P49736 904 aa18.33■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 ADGRA1Q86SQ6 560 aa18.33■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP18.33■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 RAI14Q9P0K7 980 aa18.33■□□□□ 0.53
CASQ1-201ENST00000368078 LAMA4Q16363 1823 aa18.33■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP18.33■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 UFL1O94874 794 aa18.33■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 NPR1P16066 1061 aa18.33■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 CHMP5Q9NZZ3 219 aa18.33■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 PSMA5P28066 241 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 HAND2P61296 217 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 SP8Q8IXZ3 490 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 MIGA1Q8NAN2 632 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF384Q8TF68 577 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 AIDAQ96BJ3 306 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 ARMT1Q9H993 441 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 GGA1Q9UJY5 639 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 CACNA1SQ13698 1873 aa18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 MBD4O95243 580 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 CYP7A1P22680 504 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 TBC1D16Q8TBP0 767 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 NEK1Q96PY6 1258 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 PRKAB2O43741 272 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 APPP05067 770 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 RPS6KB1P23443 525 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 ATP2B4P23634 1241 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 NFKBIBQ15653 356 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 C2CD5Q86YS7 1000 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 MASTLQ96GX5 879 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 QSER1Q2KHR3 1735 aa18.31■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 E7EWF7 191 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 SEMA3EO15041 775 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 LARGE1O95461 756 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 CHRNA5P30532 468 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 CUL4AQ13619 759 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 LCORLQ8N3X6 602 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 PODXL2Q9NZ53 605 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa18.3■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 C6orf229H3BNL8 230 aa18.29■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 DTNBO60941 627 aa18.29■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 ALDH1B1P30837 517 aa18.29■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 KRT32Q14532 448 aa18.29■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP18.29■□□□□ 0.52
CASQ1-201ENST00000368078 PRDX5P30044 214 aa18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms