RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362865.1

RNU6-227P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 227, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-227P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIA4P48058 902 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 RAC1P63000 192 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRM2Q14416 872 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 COL19A1Q14993 1142 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 SETDB1Q15047 1291 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 GRIK4Q16099 956 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRRT3Q5FWE3 981 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 VN1R5Q7Z5H4 357 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALYREFQ86V81 257 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO11Q86XK2 927 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 DTWD1Q8N5C7 304 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 GLIS3Q8NEA6 775 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 ASAP3Q8TDY4 903 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 BSNDQ8WZ55 320 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 MUC3BQ9H195 1237 aa4.61□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A096LPE4 126 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 A0A1W2PPZ6 126 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 H3BRJ5 948 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 DLL1O00548 723 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 ELNP15502 786 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 HGSNATQ68CP4 663 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 ALG1LQ6GMV1 187 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 SHISA2Q6UWI4 295 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBXO33Q7Z6M2 555 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 GALNT11Q8NCW6 608 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 FBF1Q8TES7 1133 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 CARD10Q9BWT7 1032 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 ABCB6Q9NP58 842 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 RNF19AQ9NV58 838 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 NLRP2Q9NX02 1062 aa4.6□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 FSCN2O14926 492 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 SELPP16109 830 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 CHRNA4P43681 627 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 ATP2B2Q01814 1243 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 NXPE4Q6UWF7 544 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 BCO2Q9BYV7 579 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 OSBPL7Q9BZF2 842 aa4.59□□□□□ -1.67
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM177BA6PVY3 158 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ERCC3P19447 782 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITPKAP23677 461 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ITGB7P26010 798 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 CABP4P57796 275 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 IKBKEQ14164 716 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAM117BQ6P1L5 589 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD163Q86VB7 1156 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 MAP4K3Q8IVH8 894 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 SLC7A3Q8WY07 619 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHDC7BQ96G42 594 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF576Q9H609 170 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 SEC31BQ9NQW1 1179 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 KCNK4Q9NYG8 393 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 TRAK1Q9UPV9 953 aa4.58□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADAM11O75078 769 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 APBA3O96018 575 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 FCGRTP55899 365 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 PIP4K2BP78356 416 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 PCDH1Q08174 1060 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ZNF423Q2M1K9 1284 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 IGF2-ASQ6U949 168 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 KLHL23Q8NBE8 558 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 WNT8BQ93098 351 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 OSGEPQ9NPF4 335 aa4.57□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 C9orf172C9J069 976 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 WISP1O95388 367 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 GNA15P30679 374 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 CD68P34810 354 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 C19orf57Q0VDD7 668 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 FAAP100Q0VG06 881 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 C3orf58Q8NDZ4 430 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 NACC1Q96RE7 527 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 C12orf49Q9H741 205 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 PARP2Q9UGN5 583 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 SPG7Q9UQ90 795 aa4.56□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 GIPC1O14908 333 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 B3GALT4O96024 378 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ARL4DP49703 201 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 NLRP12P59046 1061 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 ADGRE1Q14246 886 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 MBTPS1Q14703 1052 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 DTHD1Q6ZMT9 781 aa4.55□□□□□ -1.68
RNU6-227P-201ENST00000362865 UBASH3BQ8TF42 649 aa4.55□□□□□ -1.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms