RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 MCM5P33992 734 aa24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1-202ENST00000335475 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP24.44■■□□□ 1.5
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KCNQ1-202ENST00000335475 C4AP0C0L4 1744 aa24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1-202ENST00000335475 C4BP0C0L5 1744 aa24.44■■□□□ 1.5
KCNQ1-202ENST00000335475 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1-202ENST00000335475 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.43■■□□□ 1.5
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KCNQ1-202ENST00000335475 AK7Q96M32 723 aa24.43■■□□□ 1.5
KCNQ1-202ENST00000335475 DACT1Q9NYF0 836 aa24.43■■□□□ 1.5
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KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC87Q9NVE4 849 aa24.42■■□□□ 1.5
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KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF213O14771 459 aa24.37■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 BICD2Q8TD16 824 aa24.37■■□□□ 1.49
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KCNQ1-202ENST00000335475 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa24.36■■□□□ 1.49
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KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GUL6 1792 aa24.36■■□□□ 1.49
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KCNQ1-202ENST00000335475 NKX2-3Q8TAU0 364 aa24.36■■□□□ 1.49
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KCNQ1-202ENST00000335475 RTL9Q8NET4 1388 aa24.35■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 ATL3Q6DD88 541 aa24.35■■□□□ 1.49
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KCNQ1-202ENST00000335475 GOLGA8BA8MQT2 603 aa24.35■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP24.35■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 CKAP2LQ8IYA6 745 aa24.35■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF831Q5JPB2 1677 aa24.34■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa24.34■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa24.34■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 NTSR2O95665 410 aa24.34■■□□□ 1.49
KCNQ1-202ENST00000335475 GUCY1B3Q02153 619 aa24.34■■□□□ 1.49
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