RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000306167.11

MTM1-201, Transcript of myotubularin 1, humanhuman

TSL 5

Gene MTM1, Length 2,955 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1-201ENST00000306167 CHRNA5P30532 468 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 POTEHQ6S545 545 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SAP130Q9H0E3 1048 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 RNF186Q9NXI6 227 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 HACL1Q9UJ83 578 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ACEP12821 1306 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 USP47Q96K76 1375 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 NSD3Q9BZ95 1437 aa6.7□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 A0A1W2PPC1 479 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ANKRD62A6NC57 917 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 RIMBP2O15034 1052 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 MPSTP25325 297 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 EPHX2P34913 555 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TMC1Q8TDI8 760 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ACBD3Q9H3P7 528 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ABCC6O95255 1503 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 POTEB2H3BUK9 544 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 FOXK2Q01167 660 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SIX5Q8N196 739 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 LNPKQ9C0E8 428 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 DNAJA1P31689 397 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 METTL16Q86W50 562 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 LARGE2Q8N3Y3 721 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 MPHOSPH9Q99550 1183 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa6.69□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 CCDC7Q96M83 1385 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 LY75O60449 1722 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 VAMP1P23763 118 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 DEKP35659 375 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 NLRP13Q86W25 1043 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 BDP1A6H8Y1 2624 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 NFKBIEO00221 500 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 NEFLP07196 543 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SYNE4Q8N205 404 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SERBP1Q8NC51 408 aaKnown RBP eCLIP6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 C1orf216Q8TAB5 229 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PRO3102Q9H379 93 aa6.68□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ATP1A2P50993 1020 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 BRICD5Q6PL45 260 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 RGL4Q8IZJ4 473 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ARHGAP9Q9BRR9 750 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PARP2Q9UGN5 583 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TONSLQ96HA7 1378 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 CENPFP49454 3210 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SCTRP47872 440 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 MRE11P49959 708 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TMF1P82094 1093 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TBCELQ5QJ74 424 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 DPF3Q92784 378 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 RPTORQ8N122 1335 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 E9PCH4 1651 aa6.67□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SCN4AP35499 1836 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ZBTB33Q86T24 672 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ATCAYQ86WG3 371 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 NUDT12Q9BQG2 462 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 CAPN10Q9HC96 672 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TRAF5O00463 557 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 IL2RBP14784 551 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 EGFL7Q9UHF1 273 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PTK2Q05397 1052 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 AAMPQ13685 434 aa6.66□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 ANKRD36BQ8N2N9 1353 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TRANK1O15050 2925 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 CLCN6P51797 869 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PTPRNQ16849 979 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 FAM26DQ5JW98 314 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 THAP11Q96EK4 314 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 TINF2Q9BSI4 451 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 PIF1Q9H611 641 aa6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 WDR3Q9UNX4 943 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
MTM1-201ENST00000306167 CELF2O95319 508 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 WEE1P30291 646 aa6.65□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 FANCCQ00597 558 aa6.65□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 ZNF394Q53GI3 561 aa6.65□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 TRIM50Q86XT4 487 aa6.65□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 GPR182O15218 404 aa6.64□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 CCNYL3P0C7X3 344 aa6.64□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 MAP7D1Q3KQU3 841 aa6.64□□□□□ -1.35
MTM1-201ENST00000306167 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
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