RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000113889.8

Gtf3c5-202, Transcript of General transcription factor 3C polypeptide 5, mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Gtf3c5, Length 2,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rbm33Q9CXK9 1231 aaKnown RBP16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Polr3gQ6NXY9 223 aa16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ube3cQ80U95 1083 aa16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Terf2ipQ91VL8 393 aa16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Bicd2Q921C5 820 aa16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fbxo3Q9DC63 480 aa16.01■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 GakQ99KY4 1305 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cacna1sQ02789 1880 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Kansl3A2RSY1 903 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fam184aE9PW83 1143 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 CltaO08585 235 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Fez1Q8K0X8 392 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ces1dQ8VCT4 565 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Add3Q9QYB5 706 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lama4P97927 1816 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Wdr33Q8K4P0 1330 aaKnown RBP16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Krt24A1L317 512 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Stox1B2RQL2 990 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 1700113H08RikE9Q9Q5 327 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Washc4Q3UMB9 1173 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Abtb2Q7TQI7 1024 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Adam1bQ8R534 806 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Casz1Q9CWL2 1761 aa16■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gm13023A2A8N2 498 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 1700029H14RikE9PY36 240 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Hap1O35668 628 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 U2af1l4Q8BGJ9 220 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Slc5a4bQ91ZP4 660 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 CpvlQ9D3S9 478 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rps6ka4Q9Z2B9 773 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mast3Q3U214 1321 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cyp3a59D3Z2W7 503 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Zbtb7aO88939 569 aaKnown RBP15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 GabrdP22933 449 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Usp25P57080 1055 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Nme8Q715T0 586 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Eaf2Q91ZD6 262 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Zbtb43Q9DAI4 467 aa15.99■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Hspa1lP16627 641 aa15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 TnmdQ9EP64 317 aa15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cfap44E9Q5M6 1843 aa15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Casp1P29452 402 aa15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Adcy5P84309 1262 aa15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Myl10Q62082 202 aa15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Nfe2l3Q9WTM4 660 aa15.98■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mctp1E9PV86 951 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Atp1b3P97370 278 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ttc14Q9CSP9 761 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Sall1Q9ER74 1322 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rtkn2Q14B46 604 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tpcn2Q8BWC0 731 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Mtmr3Q8K296 1196 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 SdsQ8VBT2 327 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pcdhb22Q91XZ8 794 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Odf2lQ9D478 642 aa15.97■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tyro3P55144 880 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pdcl3Q8BVF2 240 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 CrebrfQ8CDG5 640 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Tktl2Q9D4D4 627 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 FliiQ9JJ28 1271 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Prr29B1ARI9 187 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pde6aP27664 859 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 LyarQ08288 388 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Atp1a3Q6PIC6 1013 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ddrgk1Q80WW9 315 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 DymQ8CHY3 669 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Rbm43Q99J64 343 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Kcnn1Q9EQR3 537 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lgr5Q9Z1P4 907 aa15.96■□□□□ 0.15
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cyp26a1O55127 497 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Sept9Q80UG5 583 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Znfx1Q8R151 1909 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Plch1Q4KWH5 1682 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 NapbP28663 298 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 IntuQ059U7 942 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Llgl2Q3TJ91 1027 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Srp68Q8BMA6 625 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 CerkQ8K4Q7 531 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pold4Q9CWP8 107 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gja10Q9WUS4 505 aa15.95■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Frmd7A2AD83 703 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Pde4bB1AWC9 736 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Brpf3B2KF05 1204 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Npy5rO70342 466 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Dbndd1Q9CZ00 160 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Sh3bgrQ9WUZ7 214 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Znf326O88291 580 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Siah1aP61092 282 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Znf692Q3U381 531 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Agtpbp1Q641K1 1218 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Lrrc2Q8VDB8 371 aa15.94■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ccdc112A0AUP1 442 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ccdc173A0JLY1 547 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Cfap58B2RW38 873 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Ube4aE9Q735 1028 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Casp12O08736 419 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 CrcpO35427 148 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 ErmnQ5EBJ4 281 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Gimap8Q75N62 688 aa15.93■□□□□ 0.14
Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 Wdr19Q3UGF1 1341 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 57.7 ms