RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000031145.6

Pdcl2-201, Transcript of Phosducin-like protein 2, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pdcl2, Length 1,181 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Otud1Q9CUB6 454 aa10.33□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rapgef4Q9EQZ6 1011 aa10.33□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Anp32bQ9EST5 272 aaKnown RBP10.33□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm8765B7ZWJ3 1017 aa10.32□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Srsf11E9Q6E5 511 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Nedd4P46935 887 aaKnown RBP10.32□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm906Q3V0M1 1017 aa10.32□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tp53i13Q5F267 385 aa10.32□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 IarsQ8BU30 1262 aa10.32□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 PlvapQ91VC4 438 aa10.32□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tnnt1O88346 262 aa10.31□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Galnt12Q8BGT9 576 aa10.31□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prpf40aQ9R1C7 953 aaKnown RBP10.31□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mapk8ip3Q9ESN9 1337 aa10.31□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Apaf1O88879 1249 aa10.3□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm12185Q5NCB2 835 aa10.3□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Grik5Q61626 979 aa10.3□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adcy9P51830 1353 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gm3250E9Q1M3 230 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Klrk1O54709 232 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ggnbp2Q5SV77 696 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 SvopQ8BFT9 548 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf467Q8JZL0 594 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fam161aQ8QZV6 448 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Flad1Q8R123 492 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Klhdc4Q921I2 584 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 TefQ9JLC6 301 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ric1Q69ZJ7 1422 aa10.29□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Abcc12Q80WJ6 1366 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Col11a2Q64739 1736 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prdm11A2AGX3 565 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pibf1E9Q6K3 756 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 2310050C09RikG5E8Z3 280 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Aldh2P47738 519 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NogP97466 232 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 EgfrQ01279 1210 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Laptm4aQ60961 233 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slf2Q6P9P0 1278 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Q7TT23 1179 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wnk4Q80UE6 1222 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Znf428Q8C1M2 176 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ciapin1Q8WTY4 309 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pcdhb2Q91Y00 799 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plpp6Q9D4F2 292 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rnf25Q9QZR0 456 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Plch1Q4KWH5 1682 aa10.28□□□□□ -0.76
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prr5lA2AVJ5 370 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Wdr66E9Q743 1299 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 FosbP13346 338 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Lmnb1P14733 588 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tlr7P58681 1050 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ripply1Q2WG77 201 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Esco1Q69Z69 843 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Prkab2Q6PAM0 271 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fbxo10Q7TQF2 950 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Alg3Q8K2A8 438 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 AdarQ99MU3 1178 aaKnown RBP10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ubn2Q80WC1 1314 aa10.27□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Hps5P59438 1126 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Q4VA45 678 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Phf20l1Q8CCJ9 1013 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mylk2Q8VCR8 613 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cd248Q91V98 765 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dtwd2Q9D0U1 298 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 NgdnQ9DB96 315 aaKnown RBP10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Zfyve9A2A8R0 1397 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 MetP16056 1379 aa10.26□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Igf2rQ07113 2483 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 1700019A02RikA0A087WPV9 146 aa10.25□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdzd7E9Q9W7 1021 aa10.25□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mex3cQ05A36 652 aaKnown RBP10.25□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ifit1bl2Q3U687 466 aa10.25□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Fkbp5Q64378 456 aa10.25□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Slc39a6Q8C145 765 aa10.25□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Csf2rbP26955 896 aa10.24□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gja5Q01231 358 aa10.24□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Psapl1Q8C1C1 522 aa10.24□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Tango6Q8C3S2 1079 aa10.24□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gigyf1Q99MR1 1044 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pik3ap1Q9EQ32 811 aa10.24□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Ubr3Q5U430 1889 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pde4bB1AWC9 736 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Iqsec3Q3TES0 1195 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Doxl2Q6IMK7 723 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Gjd4Q8BSD4 364 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rpgrip1lQ8CG73 1264 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 St5Q924W7 1134 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Mapk8ip1Q9WVI9 707 aa10.23□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 HmgcrQ01237 887 aa10.22□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Snai1Q02085 264 aa10.22□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Samd5Q3V1H9 173 aa10.22□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Pdzph1Q8BGR1 1238 aa10.22□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Rbm5Q91YE7 815 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Dpf1Q9QX66 387 aa10.22□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Aebp2Q9Z248 504 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Spef2Q8C9J3 1734 aa10.21□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Cyp2c23E9Q5K4 494 aa10.21□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 CastP51125 788 aa10.21□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 Adam1aQ60813 791 aa10.21□□□□□ -0.77
Pdcl2-201ENSMUST00000031145 U2surpQ6NV83 1029 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 53.7 ms