RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027667.12

Pkp1-201, Transcript of Plakophilin-1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pkp1, Length 4,669 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cul7Q8VE73 1689 aa14.7□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stx1aO35526 288 aa14.7□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa1210E9Q0C6 1637 aa14.7□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sptlc2P97363 560 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acnat2Q8BGG9 420 aa14.7□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MarcksP26645 309 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Spata18Q0P557 537 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rufy1Q8BIJ7 712 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ift57Q8BXG3 429 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Dnaaf4Q8R368 420 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eid1Q9DCR4 169 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ncaph2Q8BSP2 607 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lonrf3Q9D4H7 753 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttll12Q3UDE2 639 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdca8Q8BHX3 289 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Lrrc2Q8VDB8 371 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Bloc1s4Q8VED2 215 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Themis2Q91YX0 663 aa14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ybx3Q9JKB3 361 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tuft1O08970 390 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif3cO35066 796 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc122Q8BVN0 290 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Trim52Q8CDV4 233 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arhgef6Q8K4I3 771 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Terf2ipQ91VL8 393 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssfa2Q922B9 1252 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Hspa1lP16627 641 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mdh1bQ5F204 500 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smarcc2Q6PDG5 1213 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nyap1Q6PFX7 833 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ddx10Q80Y44 875 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AdnpQ9Z103 1108 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pde8bE9Q4S1 865 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ube4aE9Q735 1028 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Arid3aQ62431 601 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Simc1E9Q6E9 1354 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nfil3O08750 462 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gpr182P43142 395 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep112Q5PR68 954 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gtf2iQ9ESZ8 998 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gdf11Q9Z1W4 405 aa14.68□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Eif6O55135 245 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gadd45bP22339 160 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Il15P48346 162 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Krt79Q8VED5 531 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mrps25Q9D125 171 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adarb2Q9JI20 745 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 AglF8VPN4 1532 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gna11P21278 359 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Pkd2l2Q9JLG4 621 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 VrtnQ3SYK4 740 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Rbm43Q99J64 343 aa14.67□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cc2d1bQ8BRN9 848 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cep152A2AUM9 1736 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Mx1P09922 631 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sun3Q5SS91 320 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 DbnlQ62418 436 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Matr3Q8K310 846 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Taf5lQ91WQ5 589 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Cdc42bpgQ80UW5 1551 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tom1l2Q5SRX1 507 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Armc3A2AU72 881 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kiaa0319Q5SZV5 1081 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Smtnl1Q99LM3 459 aa14.66□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm4340L7N2C4 268 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ssrp1Q08943 708 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Snx13Q6PHS6 957 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Tpcn2Q8BWC0 731 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Stn1Q8K2X3 378 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ftsj3Q9DBE9 838 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ndufa8Q9DCJ5 172 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Col20a1Q923P0 1320 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Akr1c19G3X9Y6 323 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MthfslL7N466 203 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sp4Q62445 782 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 2310002L09RikQ9D7L5 217 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Frmd3Q8BHD4 595 aa14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Acot9Q9R0X4 439 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
Pkp1-201ENSMUST00000027667 MeiocA2AG06 965 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Adcy5P84309 1262 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nfxl1E9Q8I7 918 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Usp25P57080 1055 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SdsQ8VBT2 327 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm45015A0A140LII9 184 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gm18336A0A140LIU8 765 aa14.64□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Sh3d21Q7TSG5 549 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kdm4cQ8VCD7 1054 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Gemin5Q8BX17 1502 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Kif22Q3V300 660 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Zrsr2Q62377 462 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Klhl10Q9D5V2 608 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 SetQ9EQU5 289 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Chd1P40201 1711 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Nlrp2Q4PLS0 1046 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Setbp1Q9Z180 1582 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ccdc129Q14B48 1034 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Jakmip3Q5DTN8 844 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Asap2Q7SIG6 958 aa14.63□□□□□ -0.07
Pkp1-201ENSMUST00000027667 Ttc41Q692V3 1318 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 47.7 ms