RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583153.2

PTPRM-214, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 713 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-214ENST00000583153 FAM234AQ9H0X4 552 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 HES4Q9HCC6 221 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DHDHQ9UQ10 334 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 POMT1Q9Y6A1 747 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IRGMA1A4Y4 181 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM212A6NML5 194 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 POM121CA8CG34 1229 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 E9PI62 339 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 F8VVB4 439 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 F8VWA3 439 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 K7N7A8 449 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 HAND1O96004 215 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IGHA1P01876 353 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM225BP0DP42 221 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCL3L1P16619 93 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PRKACAP17612 351 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MYL12AP19105 171 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 BCL3P20749 454 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MDKP21741 143 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 COX7A1P24310 79 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RCVRNP35243 200 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SAA4P35542 130 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IER3P46695 156 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 NPBWR2P48146 333 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SOX2P48431 317 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RAG2P55895 527 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 LGALS4P56470 323 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DEFA1P59665 94 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DEFA3P59666 94 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ERVFRD-1P60508 538 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 VBP1P61758 197 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ACSM1Q08AH1 577 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 EDDM3AQ14507 147 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 STEAP3Q658P3 488 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 POC5Q8NA72 575 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR5D18Q8NGL1 313 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR4F5Q8NH21 305 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SGMS2Q8NHU3 365 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CNIH3Q8TBE1 160 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 APH1BQ8WW43 257 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DYRK2Q92630 601 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TNFRSF14Q92956 283 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SNX22Q96L94 193 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SPACA5Q96QH8 159 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC32Q9BV29 185 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 BEX1Q9HBH7 125 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 FKBP14Q9NWM8 211 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 A0A075B6Q4 140 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 A0A1B0GUS0 222 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 hADV38S2A0JD32 116 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SH2D1BO14796 132 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GPR137BO60478 399 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZFPL1O95159 310 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 APOA1P02647 267 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MT-ND2P03891 347 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CD36P16671 472 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 MAP2K4P45985 399 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SCN1BQ07699 218 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PDZK1IP1Q13113 114 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF273Q14593 569 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GRK1Q15835 563 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 C17orf107Q6ZR85 190 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 LDLRAD3Q86YD5 345 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR8H2Q8N162 312 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 OR6F1Q8NGZ6 308 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 PPP1R35Q8TAP8 253 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa6.8□□□□□ -1.32
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PTPRM-214ENST00000583153 GPER1Q99527 375 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CCDC90BQ9GZT6 254 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CHST6Q9GZX3 395 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SLA2Q9H6Q3 261 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 C1RLQ9NZP8 487 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 TMEM82A0PJX8 343 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 HMX3A6NHT5 357 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SIRPB1O00241 398 aa6.79□□□□□ -1.32
PTPRM-214ENST00000583153 SULT1B1O43704 296 aa6.79□□□□□ -1.32
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