RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551483.5

CNOT2-231, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 2, human

TSL 2 BASIC

Gene CNOT2, Length 4,753 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNOT2-231	ENST00000551483	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ODAM	A1E959	279 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483		H3BQ15	152 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HSPB6	O14558	160 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CHEK1	O14757	476 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF354A	O60765	605 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CDRT1	O95170	752 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR2H2	O95918	312 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	IL18BP	O95998	194 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CD99	P14209	185 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GP9	P14770	177 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CD1D	P15813	335 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CXCL3	P19876	107 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	EVI2A	P22794	236 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CDK2	P24941	298 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LCN6	P62502	163 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXC5	Q00444	222 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CATR1	Q13166	79 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	HIST3H3	Q16695	136 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	NFAM1	Q8NET5	270 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	OR5M3	Q8NGP4	307 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SYNPR	Q8TBG9	265 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RXFP2	Q8WXD0	754 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	PP6455	Q8WZ26	134 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TSLP	Q969D9	159 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	MEPE	Q9NQ76	525 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CA10	Q9NS85	328 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	RPS6KB2	Q9UBS0	482 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	POMP	Q9Y244	141 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGAP23	Q9P227	1491 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	CACNA1S	Q13698	1873 aa		3.34	□□□□□ -1.87
CNOT2-231	ENST00000551483	LOC107984640	A0A0U1RRK4	108 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	C15orf65	H3BRN8	121 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	RPL36A-HNRNPH2	H7BZ11	118 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	HBE1	P02100	147 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM106CP	P0CH98	169 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ERG	P11308	486 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR20E	P86478	221 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR20C	P86479	221 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR20D	P86480	221 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR20B	P86481	221 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PRR20A	P86496	221 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	RGN	Q15493	299 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	UBE2V2	Q15819	145 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM52B	Q4KMG9	183 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM106A	Q4KMX7	169 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TTC32	Q5I0X7	151 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM182A	Q5T1J6	154 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SFXN4	Q6P4A7	337 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483		Q6ZN92	141 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TMEM86A	Q8N2M4	240 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	KLHDC1	Q8N7A1	406 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TPRX1	Q8N7U7	411 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	NEIL3	Q8TAT5	605 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PITX2	Q99697	317 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	APOO	Q9BUR5	198 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	NOX3	Q9HBY0	568 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PILRA	Q9UKJ1	303 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FANCA	O15360	1455 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CACNA1F	O60840	1977 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MICAL3	Q7RTP6	2002 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	CHD4	Q14839	1912 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	DHRS12	A0PJE2	317 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	UNC119B	A6NIH7	251 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ZNF724	A8MTY0	619 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TAAR5	O14804	337 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TBL1X	O60907	577 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	GABARAP	O95166	117 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	LINC00694	P0DN24	101 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	G6PC	P35575	357 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SNCA	P37840	140 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TPPP2	P59282	170 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	SLC10A2	Q12908	348 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	PSG7	Q13046	419 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ATXN7L3	Q14CW9	347 aa	Predicted RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FAM27D1	Q5T7N8	215 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FBXL22	Q6P050	247 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	RBMXL3	Q8N7X1	1067 aa	Known RBP	3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	DDIT4L	Q96D03	193 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TSPAN32	Q96QS1	320 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TSSK6	Q9BXA6	273 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	FOXQ1	Q9C009	403 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TUBA4B	Q9H853	241 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ACKR4	Q9NPB9	350 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	HS3ST2	Q9Y278	367 aa		3.34	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	3.33	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	MYH1	P12882	1939 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	NFASC	O94856	1347 aa		3.33	□□□□□ -1.88
CNOT2-231	ENST00000551483	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		3.33	□□□□□ -1.88

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