RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 IQCJQ1A5X6 159 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM241Q24JQ0 296 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C2orf68Q2NKX9 166 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RNASE12Q5GAN4 147 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DCAF12L2Q5VW00 463 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C11orf87Q6NUJ2 197 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SFXN4Q6P4A7 337 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FCRLAQ7L513 359 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35F2Q8IXU6 374 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GABRG1Q8N1C3 465 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6K6Q8NGW6 343 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF128Q8TEB7 428 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM54Q969K7 222 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SARAFQ96BY9 339 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF48Q96MX3 618 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZFP3Q96NJ6 502 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 UCN2Q96RP3 112 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TIMP4Q99727 224 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF649Q9BS31 505 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DEFB127Q9H1M4 99 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 COMMD9Q9P000 198 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SPRR3Q9UBC9 169 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PITPNC1Q9UKF7 332 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM14AQ9Y6G1 99 aa6.31□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DAPL1A0PJW8 107 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPB2A8KAH6 182 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C22orf46C9J442 243 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GABARAPH6UMI1 98 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC16A7O60669 478 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM157CP0CG43 387 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 VSIG10L2P0DP72 767 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FCGR2AP12318 317 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB7AP51149 207 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CLDN17P56750 224 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HSPB2Q16082 182 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00303Q3SY05 128 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C10orf128Q5T292 105 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GFI1BQ5VTD9 330 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2T2Q6IF00 324 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM183AQ8IXX5 376 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM123Q8N131 208 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SYS1Q8N2H4 156 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 COMMD1Q8N668 190 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF485Q8NCK3 441 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5AP2Q8NGF4 316 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PIK3IP1Q96FE7 263 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ABHD17AQ96GS6 310 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AKR1E2Q96JD6 320 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MICU1Q9BPX6 476 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A1W2PPE2 198 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM235A6NFC5 223 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DCTN6O00399 190 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CCL25O15444 150 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FCGR3AP08637 254 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CTLA4P16410 223 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SELEP16581 610 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 KLK2P20151 261 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CHRNB4P30926 498 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ARR3P36575 388 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CSNK1A1P48729 337 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R43P59537 309 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SCGB2A2Q13296 93 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2V1Q13404 147 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 Q5PR19 223 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CDC20BQ86Y33 519 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZIC4Q8N9L1 334 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR10H4Q8NGA5 316 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR52B4Q8NGK2 314 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR1J2Q8NGS2 313 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GPR148Q8TDV2 347 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNRF4Q8WWF5 429 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MUCL1Q96DR8 90 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TSSK2Q96PF2 358 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2J1Q9GZK6 312 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 WDR76Q9H967 626 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CLEC5AQ9NY25 188 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF281Q9Y2X9 895 aa6.3□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0A6YYH2 397 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TRAV39A0A0B4J263 110 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR5H14A6NHG9 310 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 A6NIN4 97 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 A6NJ64 397 aa6.29□□□□□ -1.4
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