RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517323.2

TRPS1-206, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 5

Gene TRPS1, Length 2,171 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-206ENST00000517323 SSX4O60224 188 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4L2P0CJ85 424 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4L3P0CJ86 424 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4L4P0CJ87 422 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4L5P0CJ88 424 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4L6P0CJ89 424 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4L7P0CJ90 424 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SCAND1P57086 179 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SNRPD2P62316 118 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 IKZF1Q13422 519 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 CLEC18BQ6UXF7 455 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 LINC00299Q6ZSB3 139 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZTK2 550 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ZSCAN4Q8NAM6 433 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 CLEC18CQ8NCF0 446 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 RAB3CQ96E17 227 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SULT4A1Q9BR01 284 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 CACNG6Q9BXT2 260 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DIABLOQ9NR28 239 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DECR2Q9NUI1 292 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DUX4Q9UBX2 424 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 FBLN5Q9UBX5 448 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 IL19Q9UHD0 177 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 VSTM5A8MXK1 200 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SIRPB1O00241 398 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 IL7P13232 177 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 GLRA1P23415 457 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 FGF12P61328 243 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM200AQ86VY9 491 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 FAM89BQ8N5H3 189 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 GVQW1Q8N7I0 195 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 RDH5Q92781 318 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 PTX4Q96A99 478 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 IL36GQ9NZH8 169 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 GHRLQ9UBU3 117 aa13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 NOP16Q9Y3C1 178 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF260Q3ZCT1 412 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 C11orf71Q6IPW1 123 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 FAAP20Q6NZ36 180 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SPERTQ8NA61 448 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TM2D1Q9BX74 207 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 CHST6Q9GZX3 395 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SELLP14151 372 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 CPT2P23786 658 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 COL8A2P25067 703 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SAXO1Q8IYX7 474 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 POC1AQ8NBT0 407 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 BORCS5Q969J3 196 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 YIPF5Q969M3 257 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 CMTM3Q96MX0 182 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 PECRQ9BY49 303 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TANC2Q9HCD6 1990 aa13.04□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 SSX5O60225 188 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TMEM127O75204 238 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 UPK1BO75841 260 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TNFSF4P23510 183 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ELP2Q6IA86 826 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 PYHIN1Q6K0P9 492 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ACP7Q6ZNF0 438 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 Q6ZPA2 131 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 FGFRL1Q8N441 504 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 OR56B1Q8NGI3 324 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TRIM63Q969Q1 353 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 FN3KRPQ9HA64 309 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 CBLN4Q9NTU7 201 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV39A0A0B4J263 110 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 RFPL4AA6NLU0 287 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF44P15621 663 aa13.03□□□□□ -0.32
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TRPS1-206ENST00000517323 GPR176Q14439 515 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 RAB12Q6IQ22 244 aa13.03□□□□□ -0.32
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TRPS1-206ENST00000517323 LYSMD2Q8IV50 215 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 Q8NFD4 153 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 PPP1R14BQ96C90 147 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 MS4A5Q9H3V2 200 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa13.03□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 MED13LQ71F56 2210 aa13.02□□□□□ -0.32
TRPS1-206ENST00000517323 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 MFNGO00587 321 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 ORC5O43913 435 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 OR2H2O95918 312 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 COX6B1P14854 86 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 CHATP28329 748 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 KRTAP10-9P60411 292 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 OR52W1Q6IF63 320 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 SPOCK3Q9BQ16 436 aa13.02□□□□□ -0.33
TRPS1-206ENST00000517323 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP13.02□□□□□ -0.33
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