RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384526.1

RNU6-880P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 880, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-880P, Length 107 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-880P-201ENST00000384526 ING4Q9UNL4 249 aa-1.53□□□□□ -2.65
RNU6-880P-201ENST00000384526 PTPRFP10586 1907 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 MUC22E2RYF6 1773 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ARHGEF28Q8N1W1 1705 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM92AA1XBS5 289 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 RGSL1A5PLK6 1076 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF879B4DU55 563 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 LOC730098B7Z3J9 87 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FCN3O75636 299 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SOX14O95416 240 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATP1B2P14415 290 aaPredicted RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 CTLA4P16410 223 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 GGT1P19440 569 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 MUTP22033 750 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 IL12BP29460 328 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 VHLP40337 213 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 RAB9AP51151 201 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 XKP51811 444 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 NUCB1Q02818 461 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ATP5G2Q06055 141 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ECH1Q13011 328 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SCARB2Q14108 478 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 HSP90AA5PQ58FG0 334 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 C11orf88Q6PI97 169 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 LRRC74BQ6ZQY2 392 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SCXQ7RTU7 201 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 C17orf78Q8N4C9 275 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ZNF283Q8N7M2 679 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRPV1Q8NER1 839 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 RXFP4Q8TDU9 374 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 RASSF5Q8WWW0 418 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM131CQ96AQ9 280 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 MYH16Q9H6N6 1097 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FANCEQ9HB96 536 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 RDH14Q9HBH5 336 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SYTL2Q9HCH5 934 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 VAT1LQ9HCJ6 419 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ASB3Q9Y575 518 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 NAV1Q8NEY1 1877 aa-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP-1.54□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 LRP5O75197 1615 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 PLXNC1O60486 1568 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 GRIN2BQ13224 1484 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FANCMQ8IYD8 2048 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 A0A087X0T9 212 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 A0A1W2PRG6 482 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 H3BNG1 76 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 CD3DP04234 171 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SERPIND1P05546 499 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 CRABP2P29373 138 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 NDUFA8P51970 172 aa-1.55□□□□□ -2.66
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RNU6-880P-201ENST00000384526 ACTN3Q08043 901 aaPredicted RBP-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 RALBP1Q15311 655 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 TNXAQ16473 311 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 C9orf64Q5T6V5 341 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 CD300LGQ6UXG3 332 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 DEFB123Q8N688 67 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR52B4Q8NGK2 314 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 OR1L6Q8NGR2 347 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP-1.55□□□□□ -2.66
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RNU6-880P-201ENST00000384526 SLC35G5Q96KT7 338 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SAMD8Q96LT4 415 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SERPINB11Q96P15 392 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 DERL3Q96Q80 235 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 MICU1Q9BPX6 476 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 TOLLIPQ9H0E2 274 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 FBXO44Q9H4M3 255 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 CWH43Q9H720 699 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ELOVL3Q9HB03 270 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ADA2Q9NZK5 511 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 NAGKQ9UJ70 344 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 PREX2Q70Z35 1606 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 MYO7BQ6PIF6 2116 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 NINQ8N4C6 2090 aa-1.55□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 SIPA1L1O43166 1804 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 CASZ1Q86V15 1759 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 WDR90Q96KV7 1748 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 TMEM72A0PK05 275 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ISLRO14498 428 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 GOSR2O14653 212 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 NCR3O14931 201 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 LECT2O14960 151 aa-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 ERI3O43414 337 aaKnown RBP-1.56□□□□□ -2.66
RNU6-880P-201ENST00000384526 PTTG1O95997 202 aa-1.56□□□□□ -2.66
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