RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025262.5

Ltb-201, Transcript of Lymphotoxin-beta, mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ltb, Length 1,160 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc7a8Q9QXW9 531 aa15.54■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ch25hQ9Z0F5 298 aa15.54■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Abhd16aQ9Z1Q2 558 aa15.54■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rasal1Q9Z268 799 aa15.54■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Smok3cA0A087WSF2 504 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spin2-ps6A0A140T8V2 174 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 PvrigA0A1B0GS01 234 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Proca1B0QZF7 307 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 LatO54957 242 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Stfa1P35175 97 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Aqp4P55088 323 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Hes5P70120 167 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 CebpdQ00322 268 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klra2Q60660 288 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sntb2Q61235 520 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rps27Q6ZWU9 84 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Q80VP5 184 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mmgt2Q8R3L0 123 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ebag9Q9D0V7 213 aa15.53■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Trav13n-4A0A0G2JG01 110 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tex28B1AYN9 409 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm21761J3QK00 171 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mpzl2O70255 215 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm20767O70517 169 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 AF067061O70616 171 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rtn2O70622 471 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cd1d1P11609 336 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cd1d2P11610 336 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Csnk2bP67871 215 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fhl1P97447 280 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mpzl1Q3TEW6 270 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 HlxQ61670 476 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Bend6Q6PFX2 281 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Eci3Q78JN3 317 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr1287Q7TQY1 305 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Actbl2Q8BFZ3 376 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klk14Q8CGR5 250 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 PurgQ8R4E6 350 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Spsb4Q8R5B6 273 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dsn1Q9CYC5 348 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 PaicsQ9DCL9 425 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 Keg1Q9DCY0 295 aa15.52■□□□□ 0.08
Ltb-201ENSMUST00000025262 A530032D15RikE9Q422 215 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp688E9Q5M9 274 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm8871F7AXK2 190 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp212G3X8R7 492 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cited2O35740 269 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Galr2O88854 371 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Klk1b16P04071 261 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ugt2b17P17717 530 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc35f2Q7TML3 375 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Wdr82Q8BFQ4 313 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Lrrc39Q8BGI7 337 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 SptssaQ8R207 71 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr181Q8VGQ7 317 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fgfr1op2Q9CRA9 253 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gar1Q9CY66 231 aaKnown RBP15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Dcdc2cQ9D1B8 347 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ing1Q9QXV3 279 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gsk3bQ9WV60 420 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm12117V9GXK0 151 aa15.51■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 JhyE9Q793 770 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Zfp707F6QUN2 391 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Pole2O54956 527 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Selenbp1P17563 472 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tpsb2P21845 276 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Atp4bP50992 294 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Ube2e1P52482 193 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 StomP54116 284 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cox6b1P56391 86 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 StumQ0VBF8 141 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fam57aQ5ND56 257 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Selenbp2Q63836 472 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr298Q7TS06 332 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Tmem56Q8CGF5 276 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rwdd3Q8VIL2 267 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Nde1Q9CZA6 344 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Psg23Q9D2U0 471 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Snx20Q9D2Y5 313 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Sf3a3Q9D554 501 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Psg21Q9DAV5 471 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Mettl15Q9DCL4 406 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Myoz1Q9JK37 296 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gkap1Q9JMB0 366 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 DguokQ9QX60 277 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Fbln5Q9WVH9 448 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm4707V9GXN5 68 aa15.5■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gm3033M0QWI0 180 aa15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cdk2ap1O35207 114 aa15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Cops4O88544 406 aa15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Slc2a2P14246 523 aa15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Polr3kQ9CQZ7 108 aa15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Reep6Q9JM62 201 aa15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 GnmtQ9QXF8 293 aa15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Rad18Q9QXK2 509 aaKnown RBP15.49■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr231E9Q0M4 307 aa15.48■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Olfr190K7N5T5 307 aa15.48■□□□□ 0.07
Ltb-201ENSMUST00000025262 Gabra6P16305 453 aa15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 34 ms