Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0F5

Ch25h, Cholesterol 25-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ch25hQ9Z0F5 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
Ch25hQ9Z0F5 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Ch25hQ9Z0F5 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Ch25hQ9Z0F5 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Ch25hQ9Z0F5 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ch25hQ9Z0F5 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Ch25hQ9Z0F5 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Ch25hQ9Z0F5 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Ch25hQ9Z0F5 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Ch25hQ9Z0F5 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ch25hQ9Z0F5 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ch25hQ9Z0F5 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ch25hQ9Z0F5 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ch25hQ9Z0F5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ch25hQ9Z0F5 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ch25hQ9Z0F5 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ch25hQ9Z0F5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ch25hQ9Z0F5 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ch25hQ9Z0F5 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ch25hQ9Z0F5 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Ch25hQ9Z0F5 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ch25hQ9Z0F5 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ch25hQ9Z0F5 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ch25hQ9Z0F5 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ch25hQ9Z0F5 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ch25hQ9Z0F5 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Ch25hQ9Z0F5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ch25hQ9Z0F5 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ch25hQ9Z0F5 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ch25hQ9Z0F5 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ch25hQ9Z0F5 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ch25hQ9Z0F5 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ch25hQ9Z0F5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ch25hQ9Z0F5 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ch25hQ9Z0F5 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ch25hQ9Z0F5 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ch25hQ9Z0F5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ch25hQ9Z0F5 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ch25hQ9Z0F5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ch25hQ9Z0F5 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ch25hQ9Z0F5 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ch25hQ9Z0F5 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ch25hQ9Z0F5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ch25hQ9Z0F5 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Ch25hQ9Z0F5 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ch25hQ9Z0F5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ch25hQ9Z0F5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Ch25hQ9Z0F5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ch25hQ9Z0F5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Ch25hQ9Z0F5 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ch25hQ9Z0F5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Ch25hQ9Z0F5 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ch25hQ9Z0F5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ch25hQ9Z0F5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ch25hQ9Z0F5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ch25hQ9Z0F5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Ch25hQ9Z0F5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Ch25hQ9Z0F5 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Ch25hQ9Z0F5 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Ch25hQ9Z0F5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Ch25hQ9Z0F5 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Ch25hQ9Z0F5 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Ch25hQ9Z0F5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Ch25hQ9Z0F5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ch25hQ9Z0F5 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ch25hQ9Z0F5 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ch25hQ9Z0F5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ch25hQ9Z0F5 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ch25hQ9Z0F5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ch25hQ9Z0F5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ch25hQ9Z0F5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Ch25hQ9Z0F5 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Ch25hQ9Z0F5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ch25hQ9Z0F5 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ch25hQ9Z0F5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ch25hQ9Z0F5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ch25hQ9Z0F5 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Ch25hQ9Z0F5 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ch25hQ9Z0F5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ch25hQ9Z0F5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ch25hQ9Z0F5 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ch25hQ9Z0F5 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ch25hQ9Z0F5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ch25hQ9Z0F5 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ch25hQ9Z0F5 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ch25hQ9Z0F5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ch25hQ9Z0F5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ch25hQ9Z0F5 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ch25hQ9Z0F5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ch25hQ9Z0F5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ch25hQ9Z0F5 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ch25hQ9Z0F5 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ch25hQ9Z0F5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms