Protein–RNA interactions for Protein: Q63836

Selenbp2, Selenium-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Selenbp2Q63836 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
Selenbp2Q63836 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Selenbp2Q63836 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Selenbp2Q63836 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
Selenbp2Q63836 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Selenbp2Q63836 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Selenbp2Q63836 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Selenbp2Q63836 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Selenbp2Q63836 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Selenbp2Q63836 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Selenbp2Q63836 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Selenbp2Q63836 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Selenbp2Q63836 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Selenbp2Q63836 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Selenbp2Q63836 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Selenbp2Q63836 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Selenbp2Q63836 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Selenbp2Q63836 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Selenbp2Q63836 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Selenbp2Q63836 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Selenbp2Q63836 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Selenbp2Q63836 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Selenbp2Q63836 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Selenbp2Q63836 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Selenbp2Q63836 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Selenbp2Q63836 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Selenbp2Q63836 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Selenbp2Q63836 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Selenbp2Q63836 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Selenbp2Q63836 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Selenbp2Q63836 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Selenbp2Q63836 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Selenbp2Q63836 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Selenbp2Q63836 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Selenbp2Q63836 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Selenbp2Q63836 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Selenbp2Q63836 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Selenbp2Q63836 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Selenbp2Q63836 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Selenbp2Q63836 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Selenbp2Q63836 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Selenbp2Q63836 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Selenbp2Q63836 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Selenbp2Q63836 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Selenbp2Q63836 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Selenbp2Q63836 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Selenbp2Q63836 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Selenbp2Q63836 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Selenbp2Q63836 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Selenbp2Q63836 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Selenbp2Q63836 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Selenbp2Q63836 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Selenbp2Q63836 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Selenbp2Q63836 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Selenbp2Q63836 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Selenbp2Q63836 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Selenbp2Q63836 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Selenbp2Q63836 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Selenbp2Q63836 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Selenbp2Q63836 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Selenbp2Q63836 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Selenbp2Q63836 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Selenbp2Q63836 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Selenbp2Q63836 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Selenbp2Q63836 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Selenbp2Q63836 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Selenbp2Q63836 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Selenbp2Q63836 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Selenbp2Q63836 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Selenbp2Q63836 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Selenbp2Q63836 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Selenbp2Q63836 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Selenbp2Q63836 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Selenbp2Q63836 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Selenbp2Q63836 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Selenbp2Q63836 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Selenbp2Q63836 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Selenbp2Q63836 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Selenbp2Q63836 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Selenbp2Q63836 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Selenbp2Q63836 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Selenbp2Q63836 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Selenbp2Q63836 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Selenbp2Q63836 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Selenbp2Q63836 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Selenbp2Q63836 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Selenbp2Q63836 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Selenbp2Q63836 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Selenbp2Q63836 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Selenbp2Q63836 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Selenbp2Q63836 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Selenbp2Q63836 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Selenbp2Q63836 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms