RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616395.4

TRAPPC3-209, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TRAPPC3, Length 1,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-209ENST00000616395 CALCBP10092 127 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TBC1D28Q2M2D7 210 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF181Q2M3W8 571 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPRNQ5BIV9 151 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RDH10Q8IZV5 341 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR8B12Q8NGG6 310 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR51E1Q8TCB6 317 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 C15orf40Q8WUR7 153 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 UPRTQ96BW1 309 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 EGLN1Q9GZT9 426 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PRDM13Q9H4Q3 707 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR5V1Q9UGF6 321 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 LCATP04180 440 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAS1P04201 325 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPIAL4GP0DN37 164 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB3AP20336 220 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 APLNRP35414 380 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 WNT5AP41221 380 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 MMP15P51511 669 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CAV3P56539 151 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PITPNAQ00169 270 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 MALLQ13021 153 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PDCD1Q15116 288 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM189A2Q15884 450 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM255AQ5JRV8 349 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 ZNF101Q8IZC7 436 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPICQ8N5J4 248 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PARP16Q8N5Y8 322 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR1J2Q8NGS2 313 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PHF21AQ96BD5 680 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 BCL2L14Q9BZR8 327 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPATA2Q9UM82 520 aa14.66□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 C5orf49A4QMS7 147 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHRS7CA6NNS2 312 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 APOA1P02647 267 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CCL1P22362 96 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 STOMP27105 288 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PROK1P58294 105 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 GFOD2Q3B7J2 385 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SPATA46Q5T0L3 261 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 BRD3OSQ6XYD6 125 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 RFPL4BQ6ZWI9 263 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 LAX1Q8IWV1 398 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 CDH26Q8IXH8 852 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 MFSD4AQ8N468 514 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SAMD12Q8N8I0 201 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 GDPD1Q8N9F7 314 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 LINC01006Q8NI28 216 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PP6455Q8WZ26 134 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 FGGYQ96C11 551 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 POM121L2Q96KW2 1035 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 OPA3Q9H6K4 179 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 GPR84Q9NQS5 396 aa14.65□□□□□ -0.06
TRAPPC3-209ENST00000616395 SHISA3A0PJX4 238 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 DHRS3O75911 302 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 BDKRB2P30411 391 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MAP2K3P46734 347 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 INPP1P49441 399 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR10A3P58181 314 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB11BQ15907 218 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 RGS21Q2M5E4 152 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM155Q4W5P6 130 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 ESCO2Q56NI9 601 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 UBE2NLQ5JXB2 153 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 Q6YL49 198 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 REC114Q7Z4M0 266 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR51A4Q8NGJ6 313 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR5L1Q8NGL2 311 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR10AC1Q8NH08 325 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MRAPQ8TCY5 172 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 RAB40AQ8WXH6 277 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC7A6Q92536 515 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 TMEM138Q9NPI0 162 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 STEAP1Q9UHE8 339 aa14.64□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PLSCR5A0PG75 271 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 F5H0A9 414 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 J3QRK9 145 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 J3QW42 95 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 HPGDSO60760 199 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 SLC2A1P11166 492 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MPV17P39210 176 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PAX2Q02962 417 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 IL18Q14116 193 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 C2orf68Q2NKX9 166 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 VAX1Q5SQQ9 334 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 LRRTM1Q86UE6 522 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR8H2Q8N162 312 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 FTMTQ8N4E7 242 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 MINDY2Q8NBR6 621 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR1M1Q8NGA1 313 aa14.63□□□□□ -0.07
TRAPPC3-209ENST00000616395 OR6M1Q8NGM8 313 aa14.63□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.6 ms