RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000540475.5

SEMA4D-223, Transcript of semaphorin 4D, human

TSL 3

Gene SEMA4D, Length 826 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR4M1	Q8NGD0	313 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	CEP19	Q96LK0	163 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	MBOAT4	Q96T53	435 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	10.64	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	EXOG	Q9Y2C4	368 aa	Known RBP	10.64	□□□□□ -0.71
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SEMA4D-223	ENST00000540475	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ODF3B	A8MYP8	253 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	APOL3	O95236	402 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	GABRB1	P18505	474 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	CCR9	P51686	369 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ACTC1	P68032	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ACTA1	P68133	377 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF146	Q15072	292 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	C11orf88	Q6PI97	169 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475		Q8IYB0	196 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	SNX22	Q96L94	193 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ADI1	Q9BV57	179 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	CDCA4	Q9BXL8	241 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PLEKHA1	Q9HB21	404 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	RAB18	Q9NP72	206 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR14J1	Q9UGF5	321 aa		10.63	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	TMEM82	A0PJX8	343 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	SAC3D1	A6NKF1	404 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ENTPD6	O75354	484 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	CIB2	O75838	187 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	MT-ND2	P03891	347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF728	P0DKX0	622 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ATP6V1E1	P36543	226 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	RBP2	P50120	134 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ALDH3A2	P51648	485 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	EFNB2	P52799	333 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ODF4	Q2M2E3	257 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	TP53I3	Q53FA7	332 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PDLIM3	Q53GG5	364 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	TCF23	Q7RTU1	214 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	DTX3	Q8N9I9	347 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PYDC1	Q8WXC3	89 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	CFHR4	Q92496	578 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	MALSU1	Q96EH3	234 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	BORCS8	Q96FH0	119 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	TCF7L1	Q9HCS4	588 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	TBL2	Q9Y4P3	447 aa	Known RBP	10.62	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	KIAA2026	Q5HYC2	2103 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	TRBV2	A0A0J9YWF9	115 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	SLC16A6	O15403	523 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ALX3	O95076	343 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	IGHV1-8	P0DP01	117 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ATF1	P18846	271 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	NPBWR2	P48146	333 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	DYNLT3	P51808	116 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	BMX	P51813	675 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ATP1B3	P54709	279 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	DEFA6	Q01524	100 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	LDLRAD2	Q5SZI1	272 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF626	Q68DY1	528 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZFP1	Q6P2D0	407 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	FAM220A	Q7Z4H9	259 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	BATF2	Q8N1L9	274 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	SLAMF9	Q96A28	289 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	SPSB1	Q96BD6	273 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	RNFT2	Q96EX2	444 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	ZNF649	Q9BS31	505 aa		10.61	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475		H3BSH0	61 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	EI24	O14681	340 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	CHST1	O43916	411 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PRKACB	P22694	351 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	LMO1	P25800	156 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PAX6	P26367	422 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	GABRA5	P31644	462 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	LGALS4	P56470	323 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	OR12D2	P58182	307 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	SPIN3	Q5JUX0	258 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	LHFPL4	Q7Z7J7	247 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	FAM58A	Q8N1B3	248 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475	DYNAP	Q8N1N2	210 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SEMA4D-223	ENST00000540475		Q8N2B8	174 aa		10.6	□□□□□ -0.71

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