RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP16.99■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 OR8J1Q8NGP2 316 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 OR13D1Q8NGV5 346 aa16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FAM110DQ8TAY7 271 aaPredicted RBP16.99■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 PP6455Q8WZ26 134 aa16.99■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 SIGLEC9Q9Y336 463 aa16.99■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa16.98■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP16.98■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 RFKQ969G6 155 aa16.98■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 PIPP12273 146 aaPredicted RBP16.97■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa16.96■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 OPN1MW2P0DN77 364 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 OPN1MW3P0DN78 364 aa16.96■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 C1orf146Q5VVC0 180 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 TCF23Q7RTU1 214 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 FAM220AQ7Z4H9 259 aa16.96■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 DYNAPQ8N1N2 210 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 RPS4Y2Q8TD47 263 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 SLAMF9Q96A28 289 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 EME1Q96AY2 570 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF714Q96N38 554 aa16.96■□□□□ 0.31
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF702PQ9H963 129 aa16.96■□□□□ 0.31
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LIMS1-208ENST00000428064 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 OAZ3Q9UMX2 235 aa16.95■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 hADV38S2A0JD32 116 aa16.94■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM82A0PJX8 343 aa16.94■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 A6NDX4 124 aa16.94■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 ATP6V1E1P36543 226 aa16.94■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 ZNF85Q03923 595 aa16.94■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF91Q05481 1191 aa16.94■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF146Q15072 292 aa16.94■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa16.94■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa16.93■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 KIR3DL2P43630 455 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 FAM189A2Q15884 450 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 SPIN3Q5JUX0 258 aa16.93■□□□□ 0.3
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LIMS1-208ENST00000428064 TMEM244Q5VVB8 128 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 FDX2Q6P4F2 183 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 CCBE1Q6UXH8 406 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 C1QL4Q86Z23 238 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 GNG8Q9UK08 70 aa16.93■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 H3BSH0 61 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 CYB5AP00167 134 aa16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ERP29P30040 261 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
LIMS1-208ENST00000428064 ATP1B3P54709 279 aa16.92■□□□□ 0.3
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