RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000421462.5

PKP4-204, Transcript of plakophilin 4, humanhuman

TSL 2

Gene PKP4, Length 3,099 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4-204ENST00000421462 TMEM131Q92545 1883 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 PTPRSQ13332 1948 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 G0S2P27469 103 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ZNF880Q6PDB4 577 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 REC114Q7Z4M0 266 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 LRRC18Q8N456 261 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 OR10AD1Q8NGE0 317 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 HAS2Q92819 552 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 WWTR1Q9GZV5 400 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 HSF4Q9ULV5 492 aa14.56□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 DBHP09172 617 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TUBG1P23258 451 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SFTPDP35247 375 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 HNF4GQ14541 408 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 CHST11Q9NPF2 352 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SERINC1Q9NRX5 453 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 LANCL2Q9NS86 450 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 PISDQ9UG56 409 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 C2orf16Q68DN1 1984 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 A0A0G2JNG1 304 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TSPAN2O60636 221 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 RAB11AP62491 216 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP14.55□□□□□ -0.083e-7■■□□□ 13
PKP4-204ENST00000421462 FOXF1Q12946 379 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 KIR2DS5Q14953 304 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ABHD5Q8WTS1 349 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 WASF3Q9UPY6 502 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 THADAQ6YHU6 1953 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SMCO3A2RU48 225 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 HSD17B6O14756 317 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SSSCA1O60232 199 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 C5orf24Q7Z6I8 188 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 DTX1Q86Y01 620 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SLC38A9Q8NBW4 561 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 GPBAR1Q8TDU6 330 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ANXA10Q9UJ72 324 aa14.55□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ZFP92A6NM28 416 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 K7N7A8 449 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 CYTIPO60759 359 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 MMP9P14780 707 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 PPA1Q15181 289 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 RHBDD1Q8TEB9 315 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 HPSE2Q8WWQ2 592 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 YPEL4Q96NS1 127 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ANAPC10Q9UM13 185 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 CCDC187A0A096LP49 1063 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TERTO14746 1132 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TNFRSF10CO14798 259 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 IGKV3-11P04433 115 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 THEGLP0DJG4 465 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 CSNK1A1P48729 337 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 NECAP1Q8NC96 275 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 FAM210BQ96KR6 192 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 NAA60Q9H7X0 242 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 GPR173Q9NS66 373 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 GNG13Q9P2W3 67 aa14.54□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TLCD2A6NGC4 264 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SRP19P09132 144 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 PKIAP61925 76 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 HIKESHIQ53FT3 197 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 DPPA2Q7Z7J5 298 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TVP23CQ96ET8 276 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SLC2A9Q9NRM0 540 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 CUTCQ9NTM9 273 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 FBLN5Q9UBX5 448 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 PIGLQ9Y2B2 252 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 CPAMD8Q8IZJ3 1885 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ZNF407Q9C0G0 2248 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 H3BP45 60 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 FOLR1P15328 257 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 DUSP1P28562 367 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 FZD2Q14332 565 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TMEM187Q14656 261 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 OR5C1Q8NGR4 320 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TMEM234Q8WY98 164 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ZNF160Q9HCG1 818 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 BRWD1Q9NSI6 2320 aa14.53□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 NKX2-6A6NCS4 301 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SEMA4FO95754 770 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 IGHMP01871 453 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 IL2RGP31785 369 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 TAS2R60P59551 318 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SLC25A24Q6NUK1 477 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SLC22A25Q6T423 547 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 SLC35G3Q8N808 338 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 LFNGQ8NES3 379 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 OR14L1PQ8NHC6 308 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 ARV1Q9H2C2 271 aa14.52□□□□□ -0.08
PKP4-204ENST00000421462 URB1O60287 2271 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.2 ms