RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000410856.1

RNU2-38P-201, Transcript of RNA, U2 small nuclear 38, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU2-38P, Length 79 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU2-38P-201ENST00000410856 SCN2BO60939 215 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPPAP01160 153 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PDYNP01213 254 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 BCKDHBP21953 392 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP5OP48047 213 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RELAQ04206 551 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 INCA1Q0VD86 236 aa-0.91□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 Q6ZTI0 123 aa-0.91□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-0.91□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 SMARCD1Q96GM5 515 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 POLE3Q9NRF9 147 aa-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP-0.91□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 USP47Q96K76 1375 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 DISP1Q96F81 1524 aa-0.92□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 GYG2O15488 501 aa-0.92□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 STMN1P16949 149 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ALOX5APP20292 161 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ELK4P28324 431 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 FABP6P51161 128 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 SEC61GP60059 68 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR1Q1Q15612 314 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NNATQ16517 81 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 HORMAD1Q86X24 394 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNRF2Q8NHG8 242 aa-0.92□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 PRRC1Q96M27 445 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 Q96M85 177 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 GABRG3Q99928 467 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 VCX2Q9H322 139 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 VCX3AQ9NNX9 186 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ACTR3BQ9P1U1 418 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 MRPS7Q9Y2R9 242 aaKnown RBP-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ATP8B3O60423 1300 aa-0.92□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 HERC2O95714 4834 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CACNG3O60359 315 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 SNNO75324 88 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTHP01270 115 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 GTF2F2P13984 249 aa-0.93□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRAM2Q15035 370 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 STEAP4Q687X5 459 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 C2orf91Q6ZV80 131 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 FAM231DQ6ZW35 169 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR5T3Q8NGG3 340 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TSKUQ8WUA8 353 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 SLC35G5Q96KT7 338 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RAB33BQ9H082 229 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR2D2Q9H210 308 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR51M1Q9H341 326 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TMEM38AQ9H6F2 299 aa-0.93□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 FAT1Q14517 4588 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 FREM1Q5H8C1 2179 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CACNA1AO00555 2505 aa-0.93□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZANQ9Y493 2812 aa-0.93□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 OR52A4PA6NMU1 304 aa-0.94□□□□□ -2.56
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RNU2-38P-201ENST00000410856 ANXA5P08758 320 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CRABP1P29762 137 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CDK5R1Q15078 307 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TTMPQ5BVD1 217 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 UQCC2Q9BRT2 126 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 RIBC2Q9H4K1 309 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PXMP2Q9NR77 195 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PCDH15Q96QU1 1955 aa-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP-0.94□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NSD2O96028 1365 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ANKRD65E5RJM6 399 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 NME4O00746 187 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 ZW10O43264 779 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 LSM8O95777 96 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 GPR75O95800 540 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 GUSBP08236 651 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 OR1E1P30953 314 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 HNRNPA1L2Q32P51 320 aaKnown RBP-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 KRTAP20-2Q3LI61 65 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 FBXL19-AS1Q494R0 122 aa-0.95□□□□□ -2.56
RNU2-38P-201ENST00000410856 CMTM1Q8IZ96 169 aa-0.95□□□□□ -2.56
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