RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ELMOD3Q96FG2 381 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 AJUBAQ96IF1 538 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SLC30A2Q9BRI3 323 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 FAM192AQ9GZU8 254 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RNF167Q9H6Y7 350 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MSL2Q9HCI7 577 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM100Q9NV29 134 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 FBXO9Q9UK97 447 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CEPT1Q9Y6K0 416 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PLCE1Q9P212 2302 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.51□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CADP27708 2225 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1W2PPR1 153 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SMIM30A4D0T7 59 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SPRY3O43610 288 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 GMDSO60547 372 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CDRT1O95170 752 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MAS1P04201 325 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SSTR2P30874 369 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PPOXP50336 477 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MMP15P51511 669 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MXD1Q05195 221 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF529Q6P280 563 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 JAGN1Q8N5M9 183 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF611Q8N823 705 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SPERTQ8NA61 448 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR2Z1Q8NG97 314 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 NDNFQ8TB73 568 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 HPSE2Q8WWQ2 592 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 OR5P3Q8WZ94 311 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 BORCS8Q96FH0 119 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 GPER1Q99527 375 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 DCSTAMPQ9H295 470 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CXXC4Q9H2H0 198 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CBLN4Q9NTU7 201 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 C14orf119Q9NWQ9 140 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 HECTD1Q9ULT8 2610 aa6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.5□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 A0A1B0GWJ7 208 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 LRP5LA4QPB2 252 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 A6NLC8 198 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM210A6NLX4 147 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 C17orf100A8MU93 164 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF732B4DXR9 585 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 F5H5P2 479 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 MLNRO43193 412 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 IL1AP01583 271 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV1-46P01743 117 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PRF1P14222 555 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ADRA2CP18825 462 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SRMP19623 302 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RAB3BP20337 219 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SDC2P34741 201 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TGFBR1P36897 503 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 POU3F4P49335 361 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RBP2P50120 134 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 GPM6AP51674 278 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 FUT6P51993 359 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ATP1B3P54709 279 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 GNG3P63215 75 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TNFAIP6P98066 277 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ICAM4Q14773 271 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 SPCS2Q15005 226 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 UBE2V2Q15819 145 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RAB11BQ15907 218 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 PCGF3Q3KNV8 242 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 CEACAM21Q3KPI0 293 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 GLT8D1Q68CQ7 371 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 Q6ZR03 302 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 KRT74Q7RTS7 529 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 LRRTM1Q86UE6 522 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 DTX2Q86UW9 622 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TPRA1Q86W33 373 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF573Q86YE8 665 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 DNAAF1Q8NEP3 725 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RFT1Q96AA3 541 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 C14orf79Q96F83 325 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 RNF170Q96K19 258 aa6.49□□□□□ -1.37
GARNL3-218ENST00000487565 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.4 ms