RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428858.1

TTC28-AS1-209, TTC28 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4

Gene TTC28-AS1, Length 565 nt, Biotype retained intron.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPR173Q9NS66 373 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF221Q9UK13 617 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDZD2O15018 2839 aa6.9□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 POLQO75417 2590 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRP5LA4QPB2 252 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A6NIN4 97 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 VWC2LB2RUY7 222 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF879B4DU55 563 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF732B4DXR9 585 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCRL2O00421 344 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FSTL3O95633 263 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRKACAP17612 351 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ATF1P18846 271 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 COL8A2P25067 703 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PSMB9P28065 219 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PMELP40967 661 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SOX2P48431 317 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FUT6P51993 359 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ART1P52961 327 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GP2P55259 537 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM33P57088 247 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RPS25P62851 125 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GNG3P63215 75 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IFITM2Q01629 132 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF154Q13106 437 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RIN1Q13671 783 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDK10Q15131 360 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MPPED2Q15777 294 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NEDD8Q15843 81 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 DGUOKQ16854 277 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLEC12BQ2HXU8 276 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 HFEQ30201 348 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 Q5PR19 223 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MOGAT3Q86VF5 341 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PHYHIPQ92561 330 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMED9Q9BVK6 235 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IFT22Q9H7X7 185 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FN3KRPQ9HA64 309 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZC4H2Q9NQZ6 224 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM106BQ9NUM4 274 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MBD2Q9UBB5 411 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CACNG2Q9Y698 323 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ITPR2Q14571 2701 aa6.89□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LRRC30A6NM36 301 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIN1P1O15428 100 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CDC14BO60729 498 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 B3GALNT1O75752 331 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 UCHL1P09936 223 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 RAB3AP20336 220 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MPZP25189 248 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PDLIM4P50479 330 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 GPM6AP51674 278 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PPP5CP53041 499 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FABP5Q01469 135 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 INSL4Q14641 139 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ACSM3Q53FZ2 586 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CLEC2AQ6UVW9 174 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM91Q6ZNR0 172 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CEACAM19Q7Z692 300 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ZNF573Q86YE8 665 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TGIF2LYQ8IUE0 185 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 OR11L1Q8NGX0 322 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 AQP3Q92482 292 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM168AQ92567 244 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CCL17Q92583 94 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM203Q969S6 136 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PKIBQ9C010 78 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 SCPEP1Q9HB40 452 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NOX4Q9NPH5 578 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM138Q9NPI0 162 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 C1orf123Q9NWV4 160 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TAS2R4Q9NYW5 299 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 CKLFQ9UBR5 152 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A3GALT2U3KPV4 340 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 ROS1P08922 2347 aa6.88□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 PLCE1Q9P212 2302 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 IGHV4-30-2A0A087WSY4 118 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 A6NLC8 198 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 LYNX1G3V0Z9 82 aa6.87□□□□□ -1.31
TTC28-AS1-209ENST00000428858 TMEM178BH3BS89 294 aa6.87□□□□□ -1.31
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 112.3 ms