RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000626236.2

SGMS1-211, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SGMS1, Length 1,013 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-211ENST00000626236 GNG3P63215 75 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 BLMHQ13867 455 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MPPED2Q15777 294 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DDI2Q5TDH0 399 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GDPGP1Q6ZNW5 385 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 WDR86Q86TI4 376 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MOGAT3Q86VF5 341 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CELF2-AS1Q8N7Q2 184 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR52N4Q8NGI2 321 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NEU4Q8WWR8 484 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RFT1Q96AA3 541 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SPSB1Q96BD6 273 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LURAP1Q96LR2 239 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 KCTD7Q96MP8 289 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SNTG1Q9NSN8 517 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 UFSP2Q9NUQ7 469 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TREM2Q9NZC2 230 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.21□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SHISA3A0PJX4 238 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LRP5LA4QPB2 252 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CCDC160A6NGH7 325 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CDIPTO14735 213 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CDC14BO60729 498 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NOL3O60936 208 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NDUFS7O75251 213 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ALX3O95076 343 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GABARAPO95166 117 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 IGHV4-39P01824 125 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ADRA2CP18825 462 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RBMXP38159 391 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PTH2RP49190 550 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 POU3F4P49335 361 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 EFNA4P52798 201 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 VBP1P61758 197 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NCS1P62166 190 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF154Q13106 437 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 HNRNPA0Q13151 305 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 KISS1Q15726 138 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RNF144BQ7Z419 303 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF573Q86YE8 665 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CALHM1Q8IU99 346 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 JAGN1Q8N5M9 183 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SCCPDHQ8NBX0 429 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR5D18Q8NGL1 313 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ZNF420Q8TAQ5 688 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PERPQ96FX8 193 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GPER1Q99527 375 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 FAM192AQ9GZU8 254 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR51I2Q9H344 312 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 FN3KRPQ9HA64 309 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GCM1Q9NP62 436 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 C1orf123Q9NWV4 160 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PPP1R3CQ9UQK1 317 aa7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 BAHCC1Q9P281 2608 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 UNC79Q9P2D8 2635 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 hCG_1807616A0A1W2PRN6 198 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SMIM30A4D0T7 59 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MEGF11A6BM72 1044 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LYNX1G3V0Z9 82 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PDCD5O14737 125 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SSX4O60224 188 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RHBDL1O75783 438 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CDRT1O95170 752 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PTBP3O95758 552 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ALDOBP05062 364 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CLEC2LP0C7M8 214 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 LYNX1P0DP58 116 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 DAOP14920 347 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 PAX1P15863 534 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 RAB3BP20337 219 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 COL8A2P25067 703 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SDC2P34741 201 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 GATA4P43694 442 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR3A4PP47883 348 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 SERPINB10P48595 397 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MTNR1BP49286 362 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 TMBIM6P55061 237 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 ATP5J2P56134 94 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 OR10A3P58181 314 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 MXD1Q05195 221 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CARTPTQ16568 116 aa7.19□□□□□ -1.26
SGMS1-211ENST00000626236 CTF1Q16619 201 aa7.19□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.5 ms