RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553628.1

AC009396.1-201, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene AC009396.1, Length 1,079 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AC009396.1-201ENST00000553628 GLO1Q04760 184 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TSNQ15631 228 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 GABRA6Q16445 453 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 BCL2A1Q16548 175 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 GLYR1Q49A26 553 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TIMM23BQ5SRD1 257 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SULT1C3Q6IMI6 304 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 C16orf87Q6PH81 154 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 HACD2Q6Y1H2 254 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 Q6ZT83 130 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OLIG3Q7RTU3 272 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 ERASQ7Z444 233 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 GOLGA7Q7Z5G4 137 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 LRRC6Q86X45 466 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 MISPQ8IVT2 679 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 CCDC36Q8IYA8 594 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 ZNF100Q8IYN0 542 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 CEND1Q8N111 149 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 CENPSQ8N2Z9 138 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OR4M2Q8NGB6 313 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC25A36Q96CQ1 311 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TBCDQ9BTW9 1192 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 PCBD2Q9H0N5 130 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OR51B6Q9H340 312 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 BEX1Q9HBH7 125 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 LYRM4Q9HD34 91 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 EXOSC3Q9NQT5 275 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 LYARQ9NX58 379 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 P2RX2Q9UBL9 471 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 LAMP5Q9UJQ1 280 aa3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 PTBP2Q9UKA9 531 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 A0A0A6YYD5 115 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TRIM49D1C9J1S8 452 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 LGALS8O00214 317 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 NDUFA7O95182 113 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 IGHV2-5P01817 119 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 KRT6AP02538 564 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OPN1MWP04001 364 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 C8GP07360 202 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 CECR9P0C854 216 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OPN1MW2P0DN77 364 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OPN1MW3P0DN78 364 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 RRASP10301 218 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SDC1P18827 310 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OGNP20774 298 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 PAX6P26367 422 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SOX6P35712 828 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 MAGEA3P43357 314 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 MAGEA6P43360 314 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 PPOXP50336 477 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 XKP51811 444 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 RAP1GDS1P52306 607 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 RAB10P61026 200 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 BASP1P80723 227 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 PLPPR5Q32ZL2 321 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TTLL9Q3SXZ7 439 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TMEM41BQ5BJD5 291 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 UFSP1Q6NVU6 142 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SCIMPQ6UWF3 145 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 PDZD9Q8IXQ8 264 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SYCE1Q8N0S2 351 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 RIBC1Q8N443 379 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TBC1D19Q8N5T2 526 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 OR9A2Q8NGT5 310 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 RNF138Q8WVD3 245 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKRD49Q8WVL7 239 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 RAB8BQ92930 207 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 DOK1Q99704 481 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TXN2Q99757 166 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 ERP44Q9BS26 406 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 TSGA10Q9BZW7 698 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 RAB1BQ9H0U4 201 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 NOX3Q9HBY0 568 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC17A5Q9NRA2 495 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 CHRNA9Q9UGM1 479 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 NUP50Q9UKX7 468 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SNX12Q9UMY4 172 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 ABCG2Q9UNQ0 655 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 AP4B1Q9Y6B7 739 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 U3KQK5 164 aa3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP3.59□□□□□ -1.83
AC009396.1-201ENST00000553628 ISPDA4D126 451 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 OR6C70A6NIJ9 312 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 OR6C65A6NJZ3 312 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 ANKRD30BLA7E2S9 258 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 CDH16O75309 829 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 SCELO95171 688 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 SLC35E2BP0CK96 405 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PCMT1P22061 227 aa3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PAICSP22234 425 aaKnown RBP3.58□□□□□ -1.84
AC009396.1-201ENST00000553628 PTBP1P26599 531 aaKnown RBP eCLIP3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40.9 ms