RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449058.6

TOM1-210, Transcript of target of myb1 membrane trafficking protein, human

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene TOM1, Length 2,389 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TOM1-210	ENST00000449058	TNFSF11	O14788	317 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CBR3	O75828	277 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	DBH	P09172	617 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	OR3A2	P47893	321 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF84	P51523	738 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TMEM156	Q8N614	296 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ZBTB44	Q8NCP5	570 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	OR5AP2	Q8NGF4	316 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	LHFPL5	Q8TAF8	219 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	STOML3	Q8TAV4	291 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SRXN1	Q9BYN0	137 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	LDAH	Q9H6V9	325 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	HPF1	Q9NWY4	346 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MTRF1	O75570	445 aa	Known RBP	14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TDGF1	P13385	188 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PI3	P19957	117 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SERPINA2	P20848	420 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SLC9A3R2	Q15599	337 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SPTSSA	Q969W0	71 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF837	Q96EG3	531 aa	Predicted RBP	14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PIK3IP1	Q96FE7	263 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PIGQ	Q9BRB3	760 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FAM117A	Q9C073	453 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PLEK2	Q9NYT0	353 aa		14.82	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	NSG1	A0A0A6YYJ2	146 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058		H0YIZ8	118 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	KCNAB3	O43448	404 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	DNPH1	O43598	174 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	LYL1	P12980	280 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PGAM2	P15259	253 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RPS2	P15880	293 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CRYGS	P22914	178 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CPT2	P23786	658 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	B3GALT5-AS1	P59052	145 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ARL6IP1	Q15041	203 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PPA1	Q15181	289 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ANKRD55	Q3KP44	614 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	DCUN1D4	Q92564	292 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SGK3	Q96BR1	496 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SF3B5	Q9BWJ5	86 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SDCBP	O00560	298 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ADAP1	O75689	374 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PEAR1	Q5VY43	1037 aa	Predicted RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PIGT	Q969N2	578 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RRNAD1	Q96FB5	475 aa	Known RBP	14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TAS2R3	Q9NYW6	316 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	EHF	Q9NZC4	300 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PRELID1	Q9Y255	219 aa		14.81	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	GJE1	A6NN92	205 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	HTR3B	O95264	441 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ELP2	Q6IA86	826 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RTL6	Q6ICC9	239 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	UNQ6126/PRO20091	Q6UXV3	157 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	OR52H1	Q8NGJ2	320 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MAFIP	Q8WZ33	124 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	S100A13	Q99584	98 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PRKACB	P22694	351 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RAC3	P60763	192 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	NAAA	Q02083	359 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RSPO4	Q2I0M5	234 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PRR13	Q9NZ81	148 aa		14.8	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TRIOBP	Q9H2D6	2365 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MPTX1	A8MV57	137 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MASP2	O00187	686 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TSPAN4	O14817	238 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FGF16	O43320	207 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	GLRA1	P23415	457 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FOLR3	P41439	243 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	DUSP3	P51452	185 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	ZNF273	Q14593	569 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RAB35	Q15286	201 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PRSS54	Q6PEW0	395 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	DRAM2	Q6UX65	266 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SLC30A7	Q8NEW0	376 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	EMG1	Q92979	244 aa	Known RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058		Q96M66	194 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	NECAB3	Q96P71	396 aa	Predicted RBP	14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CYTL1	Q9NRR1	136 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	NCKAP5	O14513	1909 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	RTTN	Q86VV8	2226 aa		14.79	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FIGNL2	A6NMB9	653 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PATE3	B3GLJ2	98 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SYNGR3	O43761	229 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	CHRFAM7A	Q494W8	412 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SULF2	Q8IWU5	870 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	GPR137C	Q8N3F9	429 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	SGCZ	Q96LD1	299 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	PIGM	Q9H3S5	423 aa		14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	FBXO9	Q9UK97	447 aa	Predicted RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	MCTS1	Q9ULC4	181 aa	Known RBP	14.78	□□□□□ -0.04
TOM1-210	ENST00000449058	TRIM77	I1YAP6	450 aa		14.78	□□□□□ -0.04

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