RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000020163.6

Nedd1-201, Transcript of Protein NEDD1, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nedd1, Length 3,534 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PnpP23492 289 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adh5P28474 374 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fgf17P63075 216 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rps27Q6ZWU9 84 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Sirt7Q8BKJ9 402 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lpar4Q8BLG2 370 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Fam234bQ8BYI8 624 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tram1l1Q8QZR0 363 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r21Q8R2C6 297 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plekhf2Q91WB4 249 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Smarcd2Q99JR8 531 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Eif2b1Q99LC8 305 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rgs19Q9CX84 216 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Emc4Q9CZX9 183 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rep15Q9D7T1 230 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rhebl1Q9D8T3 184 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rarres2Q9DD06 162 aa8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tnrc6aQ3UHK8 1896 aaKnown RBP8.93□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfp352A2AML7 551 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Adam6aB2RSY5 754 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnaset2aC0HKG5 259 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Rnaset2bC0HKG6 259 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr914E9PW59 316 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r76E9Q3F5 853 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ccl20O89093 97 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Selenbp1P17563 472 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 CdaP56389 146 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SgcaP82350 387 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Taar8cQ5QD05 344 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r223Q5SSA0 361 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Selenbp2Q63836 472 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Usf2Q64705 346 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Spaca9Q7TPM5 168 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1135Q7TR42 310 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 PisdQ8BSF4 406 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr994Q8VF73 314 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr1497Q8VG11 314 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Pno1Q9CPS7 248 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cyb5bQ9CQX2 146 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Magt1Q9CQY5 335 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Wdsub1Q9D0I6 474 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 9230104L09RikQ9D264 133 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Senp8Q9D2Z4 221 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Prl8a1Q9DAV8 240 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Enpp5Q9EQG7 477 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Plxnd1Q3UH93 1925 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr370E9Q848 314 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MstnO08689 376 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr13P34984 310 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Hnrnpa1P49312 320 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lbx1P52955 282 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Shc1P98083 579 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mcrip1Q3UGS4 97 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Psg19Q4KL31 475 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Elavl3Q60900 367 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Btn1a1Q62556 524 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 St6gal2Q76K27 524 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gpatch2Q7TQC7 527 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Mrps26Q80ZS3 200 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc25a40Q8BGP6 337 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Chrnb4Q8R493 495 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 RhebQ921J2 184 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Arrdc1Q99KN1 434 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Scrt1Q99M85 348 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SdhdQ9CXV1 159 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr888Q9EQA5 314 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MyotQ9JIF9 496 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 ClnkQ9QZE2 435 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SrpxQ9R0M3 464 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf318Q99PP2 2237 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Trav15d-2-dv6d-2A0A0G2JGQ7 117 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr889L7N1Y6 314 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Ntsr1O88319 424 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Cdx1P18111 268 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 LalbaP29752 143 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 1700012B07RikQ3V0S8 276 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lyg2Q3V1I0 213 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Map3k3Q61084 626 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Znf8Q8BGV5 572 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Acot4Q8BWN8 421 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn1r226Q8R2A8 298 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 BanpQ8VBU8 548 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Olfr165Q8VFA2 313 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zdhhc6Q9CPV7 413 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 TsfmQ9CZR8 324 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Q9DAE7 121 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Zfand6Q9DCH6 223 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Qtrt1Q9JMA2 403 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 MeltfQ9R0R1 738 aa8.92□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Vmn2r83E9Q0G7 864 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm8882E9Q7E4 283 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Gm10665K7N6B7 321 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 IfngP01580 155 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 SparcP07214 302 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Il5raP21183 415 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Upp1P52624 311 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Myadml2Q08AU7 307 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Tmem18Q3TUD9 140 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Lclat1Q3UN02 376 aa8.91□□□□□ -0.98
Nedd1-201ENSMUST00000020163 Slc7a15Q50E62 488 aa8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.1 ms