Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXV1

Sdhd, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] cytochrome b small subunit, mitochondrial, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhdQ9CXV1 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
SdhdQ9CXV1 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SdhdQ9CXV1 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
SdhdQ9CXV1 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SdhdQ9CXV1 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SdhdQ9CXV1 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SdhdQ9CXV1 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SdhdQ9CXV1 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SdhdQ9CXV1 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SdhdQ9CXV1 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SdhdQ9CXV1 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SdhdQ9CXV1 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SdhdQ9CXV1 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SdhdQ9CXV1 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SdhdQ9CXV1 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
SdhdQ9CXV1 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SdhdQ9CXV1 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SdhdQ9CXV1 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SdhdQ9CXV1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SdhdQ9CXV1 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SdhdQ9CXV1 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SdhdQ9CXV1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SdhdQ9CXV1 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SdhdQ9CXV1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SdhdQ9CXV1 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SdhdQ9CXV1 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SdhdQ9CXV1 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SdhdQ9CXV1 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SdhdQ9CXV1 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SdhdQ9CXV1 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SdhdQ9CXV1 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SdhdQ9CXV1 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SdhdQ9CXV1 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SdhdQ9CXV1 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SdhdQ9CXV1 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SdhdQ9CXV1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhdQ9CXV1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SdhdQ9CXV1 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SdhdQ9CXV1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SdhdQ9CXV1 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SdhdQ9CXV1 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdhdQ9CXV1 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SdhdQ9CXV1 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdhdQ9CXV1 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SdhdQ9CXV1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SdhdQ9CXV1 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SdhdQ9CXV1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SdhdQ9CXV1 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SdhdQ9CXV1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SdhdQ9CXV1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SdhdQ9CXV1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SdhdQ9CXV1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdhdQ9CXV1 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SdhdQ9CXV1 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SdhdQ9CXV1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SdhdQ9CXV1 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SdhdQ9CXV1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SdhdQ9CXV1 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SdhdQ9CXV1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
SdhdQ9CXV1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SdhdQ9CXV1 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
SdhdQ9CXV1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SdhdQ9CXV1 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SdhdQ9CXV1 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SdhdQ9CXV1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SdhdQ9CXV1 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SdhdQ9CXV1 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SdhdQ9CXV1 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SdhdQ9CXV1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SdhdQ9CXV1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SdhdQ9CXV1 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SdhdQ9CXV1 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SdhdQ9CXV1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SdhdQ9CXV1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SdhdQ9CXV1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SdhdQ9CXV1 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SdhdQ9CXV1 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SdhdQ9CXV1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SdhdQ9CXV1 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SdhdQ9CXV1 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SdhdQ9CXV1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SdhdQ9CXV1 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SdhdQ9CXV1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SdhdQ9CXV1 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SdhdQ9CXV1 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SdhdQ9CXV1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SdhdQ9CXV1 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SdhdQ9CXV1 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SdhdQ9CXV1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SdhdQ9CXV1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SdhdQ9CXV1 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SdhdQ9CXV1 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SdhdQ9CXV1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SdhdQ9CXV1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SdhdQ9CXV1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SdhdQ9CXV1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SdhdQ9CXV1 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SdhdQ9CXV1 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
SdhdQ9CXV1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
SdhdQ9CXV1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
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