Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Ccl20O89093 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Ccl20O89093 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
Ccl20O89093 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Ccl20O89093 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccl20O89093 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccl20O89093 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccl20O89093 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccl20O89093 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Ccl20O89093 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccl20O89093 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccl20O89093 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ccl20O89093 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ccl20O89093 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccl20O89093 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccl20O89093 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Ccl20O89093 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccl20O89093 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccl20O89093 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccl20O89093 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccl20O89093 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccl20O89093 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccl20O89093 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccl20O89093 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccl20O89093 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccl20O89093 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccl20O89093 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccl20O89093 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccl20O89093 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccl20O89093 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccl20O89093 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccl20O89093 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ccl20O89093 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ccl20O89093 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ccl20O89093 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ccl20O89093 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ccl20O89093 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ccl20O89093 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Ccl20O89093 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ccl20O89093 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Ccl20O89093 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccl20O89093 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Ccl20O89093 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ccl20O89093 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ccl20O89093 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ccl20O89093 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ccl20O89093 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Ccl20O89093 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Ccl20O89093 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ccl20O89093 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Ccl20O89093 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ccl20O89093 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ccl20O89093 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ccl20O89093 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ccl20O89093 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ccl20O89093 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccl20O89093 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Ccl20O89093 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ccl20O89093 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ccl20O89093 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ccl20O89093 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ccl20O89093 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ccl20O89093 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ccl20O89093 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ccl20O89093 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl20O89093 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl20O89093 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ccl20O89093 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccl20O89093 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ccl20O89093 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccl20O89093 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccl20O89093 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccl20O89093 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccl20O89093 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccl20O89093 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccl20O89093 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ccl20O89093 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccl20O89093 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccl20O89093 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccl20O89093 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccl20O89093 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccl20O89093 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccl20O89093 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccl20O89093 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccl20O89093 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccl20O89093 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccl20O89093 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl20O89093 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ccl20O89093 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ccl20O89093 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl20O89093 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl20O89093 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ccl20O89093 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl20O89093 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ccl20O89093 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ccl20O89093 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ccl20O89093 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ccl20O89093 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ccl20O89093 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ccl20O89093 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
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