RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	OR8H2	Q8N162	312 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GABRG1	Q8N1C3	465 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FGFBP3	Q8TAT2	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ORAI1	Q96D31	301 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	WDFY2	Q96P53	400 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C1QTNF5	Q9BXJ0	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NGB	Q9NPG2	151 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	AKIP1	Q9NQ31	210 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	DIABLO	Q9NR28	239 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PCDHB16	Q9NRJ7	776 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TBCCD1	Q9NVR7	557 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	B3GNT2	Q9NY97	397 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PTTG3P	Q9NZH4	202 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	EXTL2	Q9UBQ6	330 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	KCNN3	Q9UGI6	736 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TINAG	Q9UJW2	476 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SPATA2	Q9UM82	520 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OSGIN2	Q9Y236	505 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		V9GYS6	101 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TNRC6A	Q8NDV7	1962 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MED12	Q93074	2177 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1W2PR80	420 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	VSTM5	A8MXK1	200 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C16orf97	H3BN30	126 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		J3QRK9	145 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CCL21	O00585	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SLC17A2	O00624	439 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SCGN	O76038	276 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TOX	O94900	526 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	AGFG2	O95081	481 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CYB5A	P00167	134 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NRAS	P01111	189 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CRYAA	P02489	173 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ALDOB	P05062	364 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CCL2	P13500	99 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PPP3CB	P16298	524 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FAH	P16930	419 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ATF1	P18846	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PSMB1	P20618	241 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GCH1	P30793	250 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	THBS2	P35442	1172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ETV6	P41212	452 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NR4A2	P43354	598 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PITPNB	P48739	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	EVX1	P49640	407 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ATP1B3	P54709	279 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MTCP1	P56278	107 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RIN1	Q13671	783 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LY6D	Q14210	128 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PPA1	Q15181	289 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	P2RY14	Q15391	338 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TSC22D1	Q15714	1073 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RGS21	Q2M5E4	152 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SNAI3	Q3KNW1	292 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	KRTAP27-1	Q3LI81	207 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TIMM23B	Q5SRD1	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GLYATL3	Q5SZD4	288 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PYHIN1	Q6K0P9	492 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CNIH2	Q6PI25	160 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MOB3C	Q70IA8	216 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	UTS2B	Q765I0	119 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PRSS45	Q7RTY3	260 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LIX1L	Q8IVB5	337 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF101	Q8IZC7	436 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GDPD1	Q8N9F7	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C19orf18	Q8NEA5	215 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR14K1	Q8NGZ2	314 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR2AE1	Q8NHA4	323 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LGALS14	Q8TCE9	139 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PIGC	Q92535	297 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SPSB1	Q96BD6	273 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FAM3D	Q96BQ1	224 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	S100PBP	Q96BU1	408 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	BORCS8	Q96FH0	119 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC32	Q9BV29	185 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C1QTNF6	Q9BXI9	259 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	BCL2L14	Q9BZR8	327 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ATG5	Q9H1Y0	275 aa		4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.8	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ABCB10	Q9NRK6	738 aa		4.8	□□□□□ -1.64

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