RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000059272.9

Hoxd9-201, Transcript of Homeobox protein Hox-D9, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Hoxd9, Length 2,136 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adhfe1Q8R0N6 465 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Srsf4Q8VE97 489 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1254Q8VFB1 314 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr578Q8VH17 313 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Clint1Q99KN9 631 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc29a3Q99P65 475 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dppa5aQ9CQS7 118 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Emc6Q9CQW0 110 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4930503E14RikQ9D583 177 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gpx2Q9JHC0 190 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mmp16Q9WTR0 607 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PlpbpQ9Z2Y8 274 aa20.52■□□□□ 0.88
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Col5a1O88207 1838 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4933403O08RikF6UK53 379 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn2r29L7N2D4 852 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mab21l1O70299 359 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccl20O89093 97 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 PlatP11214 559 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Znf271P15620 580 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shisa3Q3UPR0 238 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Parp16Q7TMM8 322 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 BtlaQ7TSA3 306 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Q80Y39 304 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dlec1Q8BLA1 635 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rasgef1bQ8JZL7 473 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Dcun1d5Q9CXV9 237 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tomm20Q9DCC8 145 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P2ry14Q9ESG6 338 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 C1galt1Q9JJ06 363 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ighv1-78A0A0G2JGN3 117 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm4881A0A140LIR9 352 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm7951E9Q0A2 213 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm6482F6YHC1 213 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm17124F6ZIG1 213 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Aldh3b3J3QMK6 479 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hdac3O88895 424 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 DhfrP00375 187 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Rab11bP46638 218 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Uhrf2Q7TMI3 803 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Pik3ip1Q7TMJ8 264 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fam120cQ8C3F2 1091 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 FancmQ8BGE5 2021 aa20.51■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 4930563M21RikA0A1L1SUT5 578 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr1156A2AVC3 323 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Arid1aA2BH40 2283 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tomm5B1AXP6 51 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Celsr1O35161 3034 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Itln1O88310 313 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mup3P04939 184 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 UbcP0CG50 734 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Zfp13P10754 512 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bmi1P25916 324 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cnr1P47746 473 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cpeb1P70166 561 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr988Q7TRA1 309 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 TxnipQ8BG60 397 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Smim37Q8BT35 56 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Mfsd4b1Q8VCV9 425 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ear6Q923L7 155 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Ccdc167Q9D162 97 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Cmtm2aQ9DAR1 169 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm21936A0A1Y7VJE9 144 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5788A0A1Y7VK80 144 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn1r68E9Q0V3 319 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5916G5E8W5 102 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5039J3QNT6 144 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Vmn2r124K7N789 855 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 GrnP28798 589 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Upk2P38575 184 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm2016Q3TQZ4 144 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm8332Q3UTA4 144 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Epha1Q60750 977 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Svs6Q64356 99 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sdhaf4Q8BTE0 104 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm5662Q8BX20 144 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Sf3b4Q8QZY9 424 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Emc3Q99KI3 261 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Tex12Q9CR81 123 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr944Q9EQ91 311 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Slc2a8Q9JIF3 477 aa20.5■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Awat1A2ADU9 328 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr520E9Q518 316 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gstp3F6RWR5 210 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Crisp2P16563 243 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Hsd17b8P50171 259 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Shc1P98083 579 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Adam5Q3TTE0 751 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Bcap29Q61334 240 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 IrgcQ8C262 412 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Fate1Q8CEK7 99 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Klhl25Q8R2P1 589 aa20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Uqcrc1Q9CZ13 480 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm29106A0A087WSP8 697 aa20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Gm4779A0A1B0GR91 561 aa20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Prdm14E9Q3T6 561 aa20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 P01800 113 aa20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Abhd17bQ7M759 288 aa20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Olfr17Q7TRM9 315 aa20.48■□□□□ 0.87
Hoxd9-201ENSMUST00000059272 Commd7Q8BG94 200 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 30.9 ms