Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
Upk2P38575 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Upk2P38575 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Upk2P38575 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Upk2P38575 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
Upk2P38575 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Upk2P38575 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Upk2P38575 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Upk2P38575 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Upk2P38575 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Upk2P38575 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Upk2P38575 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Upk2P38575 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Upk2P38575 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Upk2P38575 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Upk2P38575 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Upk2P38575 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Upk2P38575 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Upk2P38575 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Upk2P38575 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Upk2P38575 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Upk2P38575 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Upk2P38575 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Upk2P38575 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Upk2P38575 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Upk2P38575 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Upk2P38575 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Upk2P38575 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Upk2P38575 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Upk2P38575 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Upk2P38575 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Upk2P38575 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Upk2P38575 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Upk2P38575 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Upk2P38575 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Upk2P38575 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Upk2P38575 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Upk2P38575 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Upk2P38575 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Upk2P38575 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Upk2P38575 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upk2P38575 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Upk2P38575 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Upk2P38575 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Upk2P38575 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Upk2P38575 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Upk2P38575 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Upk2P38575 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Upk2P38575 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Upk2P38575 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Upk2P38575 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Upk2P38575 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Upk2P38575 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Upk2P38575 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Upk2P38575 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Upk2P38575 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upk2P38575 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Upk2P38575 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Upk2P38575 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Upk2P38575 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Upk2P38575 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upk2P38575 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Upk2P38575 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Upk2P38575 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Upk2P38575 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Upk2P38575 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Upk2P38575 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Upk2P38575 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Upk2P38575 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Upk2P38575 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Upk2P38575 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Upk2P38575 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Upk2P38575 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Upk2P38575 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Upk2P38575 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Upk2P38575 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Upk2P38575 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Upk2P38575 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upk2P38575 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upk2P38575 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Upk2P38575 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Upk2P38575 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upk2P38575 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Upk2P38575 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Upk2P38575 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Upk2P38575 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Upk2P38575 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Upk2P38575 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Upk2P38575 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upk2P38575 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Upk2P38575 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Upk2P38575 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Upk2P38575 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upk2P38575 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Upk2P38575 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Upk2P38575 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upk2P38575 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upk2P38575 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Upk2P38575 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Upk2P38575 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms