Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32,11■■■□□ 2,73
Upk2P38575 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Upk2P38575 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Upk2P38575 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,43■■■□□ 2,3
Upk2P38575 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,27■■■□□ 2,28
Upk2P38575 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,13■■■□□ 2,25
Upk2P38575 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,57■■■□□ 2,16
Upk2P38575 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,15■■■□□ 2,1
Upk2P38575 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,14■■■□□ 2,09
Upk2P38575 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28,02■■■□□ 2,08
Upk2P38575 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,67■■■□□ 2,02
Upk2P38575 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,59■■■□□ 2,01
Upk2P38575 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Upk2P38575 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,58■■■□□ 2,01
Upk2P38575 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Upk2P38575 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Upk2P38575 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Upk2P38575 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,92
Upk2P38575 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Upk2P38575 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Upk2P38575 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Upk2P38575 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Upk2P38575 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Upk2P38575 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,9■■□□□ 1,9
Upk2P38575 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Upk2P38575 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Upk2P38575 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,85■■□□□ 1,89
Upk2P38575 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Upk2P38575 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
Upk2P38575 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Upk2P38575 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Upk2P38575 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Upk2P38575 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,58■■□□□ 1,85
Upk2P38575 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,56■■□□□ 1,84
Upk2P38575 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Upk2P38575 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Upk2P38575 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,3■■□□□ 1,8
Upk2P38575 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,24■■□□□ 1,79
Upk2P38575 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Upk2P38575 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Upk2P38575 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Upk2P38575 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,12■■□□□ 1,77
Upk2P38575 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Upk2P38575 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,91■■□□□ 1,74
Upk2P38575 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,87■■□□□ 1,73
Upk2P38575 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Upk2P38575 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,81■■□□□ 1,72
Upk2P38575 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Upk2P38575 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,65■■□□□ 1,7
Upk2P38575 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Upk2P38575 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Upk2P38575 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Upk2P38575 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Upk2P38575 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Upk2P38575 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Upk2P38575 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Upk2P38575 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Upk2P38575 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,32■■□□□ 1,64
Upk2P38575 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Upk2P38575 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Upk2P38575 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Upk2P38575 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,24■■□□□ 1,63
Upk2P38575 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,23■■□□□ 1,63
Upk2P38575 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Upk2P38575 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,2■■□□□ 1,62
Upk2P38575 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Upk2P38575 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Upk2P38575 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,15■■□□□ 1,62
Upk2P38575 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,13■■□□□ 1,61
Upk2P38575 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Upk2P38575 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Upk2P38575 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Upk2P38575 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Upk2P38575 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Upk2P38575 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,93■■□□□ 1,58
Upk2P38575 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,58
Upk2P38575 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Upk2P38575 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Upk2P38575 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Upk2P38575 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,81■■□□□ 1,56
Upk2P38575 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Upk2P38575 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Upk2P38575 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,78■■□□□ 1,56
Upk2P38575 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Upk2P38575 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Upk2P38575 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Upk2P38575 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Upk2P38575 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,63■■□□□ 1,53
Upk2P38575 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Upk2P38575 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
Upk2P38575 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,6■■□□□ 1,53
Upk2P38575 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24,58■■□□□ 1,53
Upk2P38575 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Upk2P38575 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Upk2P38575 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24,54■■□□□ 1,52
Upk2P38575 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,49■■□□□ 1,51
Upk2P38575 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Upk2P38575 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
Upk2P38575 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Upk2P38575 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,45■■□□□ 1,5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13,5 ms