Protein–RNA interactions for Protein: Q61334

Bcap29, B-cell receptor-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcap29Q61334 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC31,95■■■□□ 2,71
Bcap29Q61334 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,26■■■□□ 2,43
Bcap29Q61334 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,38■■■□□ 2,29
Bcap29Q61334 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29,31■■■□□ 2,28
Bcap29Q61334 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,23■■■□□ 2,27
Bcap29Q61334 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
Bcap29Q61334 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
Bcap29Q61334 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28,44■■■□□ 2,14
Bcap29Q61334 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Bcap29Q61334 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28,16■■■□□ 2,1
Bcap29Q61334 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,07■■■□□ 2,08
Bcap29Q61334 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27,84■■■□□ 2,05
Bcap29Q61334 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,62■■■□□ 2,01
Bcap29Q61334 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Bcap29Q61334 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,46■■□□□ 1,99
Bcap29Q61334 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27,42■■□□□ 1,98
Bcap29Q61334 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,39■■□□□ 1,98
Bcap29Q61334 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,25■■□□□ 1,95
Bcap29Q61334 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Bcap29Q61334 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Bcap29Q61334 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Bcap29Q61334 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Bcap29Q61334 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Bcap29Q61334 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,9
Bcap29Q61334 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Bcap29Q61334 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,8■■□□□ 1,88
Bcap29Q61334 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Bcap29Q61334 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,77■■□□□ 1,88
Bcap29Q61334 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Bcap29Q61334 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Bcap29Q61334 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
Bcap29Q61334 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Bcap29Q61334 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Bcap29Q61334 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
Bcap29Q61334 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Bcap29Q61334 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,55■■□□□ 1,84
Bcap29Q61334 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Bcap29Q61334 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Bcap29Q61334 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Bcap29Q61334 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Bcap29Q61334 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26,43■■□□□ 1,82
Bcap29Q61334 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26,4■■□□□ 1,82
Bcap29Q61334 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Bcap29Q61334 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26,23■■□□□ 1,79
Bcap29Q61334 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,17■■□□□ 1,78
Bcap29Q61334 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26,15■■□□□ 1,78
Bcap29Q61334 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Bcap29Q61334 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Bcap29Q61334 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Bcap29Q61334 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25,98■■□□□ 1,75
Bcap29Q61334 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Bcap29Q61334 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Bcap29Q61334 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25,81■■□□□ 1,72
Bcap29Q61334 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,8■■□□□ 1,72
Bcap29Q61334 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25,8■■□□□ 1,72
Bcap29Q61334 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Bcap29Q61334 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Bcap29Q61334 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,71■■□□□ 1,71
Bcap29Q61334 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Bcap29Q61334 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Bcap29Q61334 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Bcap29Q61334 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,37■■□□□ 1,65
Bcap29Q61334 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Bcap29Q61334 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Bcap29Q61334 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25,34■■□□□ 1,65
Bcap29Q61334 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Bcap29Q61334 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Bcap29Q61334 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Bcap29Q61334 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Bcap29Q61334 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Bcap29Q61334 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25,24■■□□□ 1,63
Bcap29Q61334 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Bcap29Q61334 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Bcap29Q61334 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Bcap29Q61334 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Bcap29Q61334 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Bcap29Q61334 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Bcap29Q61334 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Bcap29Q61334 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Bcap29Q61334 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Bcap29Q61334 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Bcap29Q61334 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,05■■□□□ 1,6
Bcap29Q61334 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Bcap29Q61334 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,03■■□□□ 1,6
Bcap29Q61334 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Bcap29Q61334 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,99■■□□□ 1,59
Bcap29Q61334 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Bcap29Q61334 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24,96■■□□□ 1,59
Bcap29Q61334 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Bcap29Q61334 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24,95■■□□□ 1,58
Bcap29Q61334 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Bcap29Q61334 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,83■■□□□ 1,57
Bcap29Q61334 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Bcap29Q61334 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,56
Bcap29Q61334 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24,81■■□□□ 1,56
Bcap29Q61334 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,8■■□□□ 1,56
Bcap29Q61334 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Bcap29Q61334 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Bcap29Q61334 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,72■■□□□ 1,55
Bcap29Q61334 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,4 ms