Protein–RNA interactions for Protein: P46638

Rab11b, Ras-related protein Rab-11B, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11bP46638 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Rab11bP46638 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
Rab11bP46638 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Rab11bP46638 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Rab11bP46638 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Rab11bP46638 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Rab11bP46638 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Rab11bP46638 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Rab11bP46638 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Rab11bP46638 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab11bP46638 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Rab11bP46638 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Rab11bP46638 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Rab11bP46638 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rab11bP46638 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Rab11bP46638 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rab11bP46638 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Rab11bP46638 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rab11bP46638 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Rab11bP46638 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rab11bP46638 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Rab11bP46638 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Rab11bP46638 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Rab11bP46638 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rab11bP46638 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rab11bP46638 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Rab11bP46638 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rab11bP46638 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rab11bP46638 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab11bP46638 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab11bP46638 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
Rab11bP46638 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rab11bP46638 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Rab11bP46638 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Rab11bP46638 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Rab11bP46638 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Rab11bP46638 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Rab11bP46638 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Rab11bP46638 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Rab11bP46638 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rab11bP46638 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rab11bP46638 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rab11bP46638 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Rab11bP46638 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Rab11bP46638 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rab11bP46638 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rab11bP46638 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Rab11bP46638 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rab11bP46638 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rab11bP46638 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Rab11bP46638 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Rab11bP46638 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Rab11bP46638 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Rab11bP46638 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rab11bP46638 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rab11bP46638 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rab11bP46638 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rab11bP46638 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rab11bP46638 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Rab11bP46638 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rab11bP46638 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rab11bP46638 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Rab11bP46638 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11bP46638 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11bP46638 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Rab11bP46638 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Rab11bP46638 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Rab11bP46638 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Rab11bP46638 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11bP46638 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Rab11bP46638 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rab11bP46638 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rab11bP46638 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rab11bP46638 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rab11bP46638 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rab11bP46638 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rab11bP46638 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rab11bP46638 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rab11bP46638 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rab11bP46638 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rab11bP46638 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11bP46638 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rab11bP46638 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11bP46638 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rab11bP46638 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11bP46638 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rab11bP46638 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rab11bP46638 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rab11bP46638 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rab11bP46638 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11bP46638 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rab11bP46638 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rab11bP46638 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rab11bP46638 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11bP46638 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rab11bP46638 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Rab11bP46638 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rab11bP46638 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Rab11bP46638 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Rab11bP46638 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms