Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCC8

Tomm20, Mitochondrial import receptor subunit TOM20 homolog, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tomm20Q9DCC8 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
Tomm20Q9DCC8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Tomm20Q9DCC8 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tomm20Q9DCC8 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tomm20Q9DCC8 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Tomm20Q9DCC8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Tomm20Q9DCC8 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Tomm20Q9DCC8 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tomm20Q9DCC8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Tomm20Q9DCC8 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Tomm20Q9DCC8 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Tomm20Q9DCC8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Tomm20Q9DCC8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Tomm20Q9DCC8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Tomm20Q9DCC8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Tomm20Q9DCC8 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Tomm20Q9DCC8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Tomm20Q9DCC8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
Tomm20Q9DCC8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Tomm20Q9DCC8 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Tomm20Q9DCC8 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tomm20Q9DCC8 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tomm20Q9DCC8 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tomm20Q9DCC8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Tomm20Q9DCC8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Tomm20Q9DCC8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tomm20Q9DCC8 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tomm20Q9DCC8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Tomm20Q9DCC8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tomm20Q9DCC8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tomm20Q9DCC8 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tomm20Q9DCC8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Tomm20Q9DCC8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Tomm20Q9DCC8 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Tomm20Q9DCC8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Tomm20Q9DCC8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Tomm20Q9DCC8 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tomm20Q9DCC8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tomm20Q9DCC8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Tomm20Q9DCC8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tomm20Q9DCC8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tomm20Q9DCC8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tomm20Q9DCC8 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tomm20Q9DCC8 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tomm20Q9DCC8 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tomm20Q9DCC8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tomm20Q9DCC8 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tomm20Q9DCC8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tomm20Q9DCC8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tomm20Q9DCC8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tomm20Q9DCC8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Tomm20Q9DCC8 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tomm20Q9DCC8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Tomm20Q9DCC8 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tomm20Q9DCC8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tomm20Q9DCC8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tomm20Q9DCC8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tomm20Q9DCC8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tomm20Q9DCC8 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tomm20Q9DCC8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Tomm20Q9DCC8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tomm20Q9DCC8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tomm20Q9DCC8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tomm20Q9DCC8 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tomm20Q9DCC8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tomm20Q9DCC8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tomm20Q9DCC8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tomm20Q9DCC8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tomm20Q9DCC8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tomm20Q9DCC8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tomm20Q9DCC8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tomm20Q9DCC8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Tomm20Q9DCC8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Tomm20Q9DCC8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Tomm20Q9DCC8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tomm20Q9DCC8 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Tomm20Q9DCC8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Tomm20Q9DCC8 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Tomm20Q9DCC8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Tomm20Q9DCC8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Tomm20Q9DCC8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tomm20Q9DCC8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tomm20Q9DCC8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tomm20Q9DCC8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tomm20Q9DCC8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tomm20Q9DCC8 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tomm20Q9DCC8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm20Q9DCC8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm20Q9DCC8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tomm20Q9DCC8 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tomm20Q9DCC8 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tomm20Q9DCC8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Tomm20Q9DCC8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm20Q9DCC8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm20Q9DCC8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tomm20Q9DCC8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tomm20Q9DCC8 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tomm20Q9DCC8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tomm20Q9DCC8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tomm20Q9DCC8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
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