RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 CHST8Q9H2A9 424 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TCFL5Q9UL49 500 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MEIKINA0A087WXM9 373 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TCAPO15273 167 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 BRS3P32247 399 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CD70P32970 193 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 KIR3DL2P43630 455 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TNFSF10P50591 281 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 HMGA2P52926 109 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 PIGPP57054 158 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TWIST1Q15672 202 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 SYPL1Q16563 259 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 BEX5Q5H9J7 111 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 SPANXN5Q5MJ07 72 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 PRR27Q6MZM9 219 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM207Q6UWW9 146 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 USP53Q70EK8 1073 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CADM3Q8N126 398 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 OR4S2Q8NH73 311 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 RPS4Y2Q8TD47 263 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GHITMQ9H3K2 345 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CCSO14618 274 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 NME2P1O60361 137 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GOSR1O95249 250 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 OR5AC1P0C628 307 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 NDUFB7P17568 137 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ATF1P18846 271 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GLRA1P23415 457 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 HOXD13P35453 343 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GPR3P46089 330 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 NAAAQ02083 359 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GAMTQ14353 236 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 LIPNQ5VXI9 398 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 OR5R1Q8NH85 324 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 PTX4Q96A99 478 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ACY3Q96HD9 319 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 RNF39Q9H2S5 420 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 EMCNQ9ULC0 261 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 FAM72CH0Y354 149 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CD27P26842 260 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ID1P41134 155 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CSNK1EP49674 416 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 RPS16P62249 146 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 HAGHQ16775 308 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ISXQ2M1V0 245 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 FAM72AQ5TYM5 149 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 OR2G6Q5TZ20 316 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 FAM72DQ6L9T8 149 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 FAM72BQ86X60 149 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TSACCQ96A04 125 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CTSFQ9UBX1 484 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF835Q9Y2P0 537 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MOB4Q9Y3A3 225 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MFSD2BA6NFX1 497 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GJB5O95377 273 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 SOD3P08294 240 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GNG3P63215 75 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 PHLDA2Q53GA4 152 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MYPOPQ86VE0 399 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM116Q8NCL8 245 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MOB3AQ96BX8 217 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 C19orf24Q9BVV8 132 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 GPR87Q9BY21 358 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 LMX1BO60663 402 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TIMP1P01033 207 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 HTRA3P83110 453 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM267Q0VDI3 215 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 SCGB1D4Q6XE38 83 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TAS1R1Q7RTX1 841 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CCDC190Q86UF4 302 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 OR52I2Q8NH67 350 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF384Q8TF68 577 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MIEN1Q9BRT3 115 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 SLC7A10Q9NS82 523 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MPC1Q9Y5U8 109 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 H0Y8G0 127 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CBR3O75828 277 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 C6orf201Q7Z4U5 140 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MRGPRGQ86SM5 289 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TM4SF18Q96CE8 201 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 C1QTNF6Q9BXI9 259 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 PRNDQ9UKY0 176 aa5.76□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 hADV38S2A0JD32 116 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 SLC10A3P09131 477 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 HOXA6P31267 233 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TGFBR1P36897 503 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 MAT1AQ00266 395 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 AFMIDQ63HM1 303 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 ZC3HAV1LQ96H79 300 aaKnown RBP5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 TAAR3PQ9P1P4 343 aa5.75□□□□□ -1.49
SCN2A-209ENST00000636071 CD96P40200 585 aa5.75□□□□□ -1.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms