RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000556067.1

ATL1-208, Transcript of atlastin GTPase 1, human

TSL 4

Gene ATL1, Length 550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATL1-208	ENST00000556067	BMP5	P22003	454 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CCL1	P22362	96 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PRKACB	P22694	351 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CRYGS	P22914	178 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	IGHV1-2	P23083	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PTBP1	P26599	531 aa	Known RBP eCLIP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CD40LG	P29965	261 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CEACAM8	P31997	349 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OTX1	P32242	354 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TNFSF8	P32971	234 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	THBS4	P35443	961 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PPP5C	P53041	499 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SCAND1	P57086	179 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	DEFA1	P59665	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	DEFA3	P59666	94 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PITPNA	Q00169	270 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GUSBP1	Q15486	140 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FAM189A2	Q15884	450 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	GABRA6	Q16445	453 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CR1L	Q2VPA4	569 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	HES5	Q5TA89	166 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RTL6	Q6ICC9	239 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	XKRX	Q6PP77	449 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	BAIAP2L2	Q6UXY1	529 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C3P1	Q6ZMU1	363 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MDP1	Q86V88	176 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LRRC28	Q86X40	367 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CXorf67	Q86X51	503 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ST6GALNAC3	Q8NDV1	305 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR51A4	Q8NGJ6	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR6M1	Q8NGM8	313 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C15orf40	Q8WUR7	153 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SLC7A6	Q92536	515 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RND1	Q92730	232 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SGK3	Q96BR1	496 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	WBP1	Q96G27	269 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CMTM3	Q96MX0	182 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TECTB	Q96PL2	329 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SORCS2	Q96PQ0	1159 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	VKORC1	Q9BQB6	163 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	BARHL1	Q9BZE3	327 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OPN3	Q9H1Y3	402 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PALMD	Q9NP74	551 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	COQ3	Q9NZJ6	369 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PIGL	Q9Y2B2	252 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF835	Q9Y2P0	537 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FAM215A	Q9Y5M1	114 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ETV7	Q9Y603	341 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CEP295	Q9C0D2	2601 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ACACA	Q13085	2346 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FREM3	P0C091	2139 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF816-ZNF321P	A0A0X1KG74	233 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067		A0A1B0GTI1	187 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	METTL21EP	A6NDL7	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR5H1	A6NKK0	313 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	HPGDS	O60760	199 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CGA	P01215	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	APOA1	P02647	267 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	UBB	P0CG47	229 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SLC2A2	P11168	524 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ARSB	P15848	533 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SELE	P16581	610 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	COX5A	P20674	150 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TUBG1	P23258	451 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	HTR2C	P28335	458 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	DDOST	P39656	456 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	RAD52	P43351	418 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MAGEB1	P43366	347 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	IDH3G	P51553	393 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ART1	P52961	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	OR10A3	P58181	314 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SPOCK1	Q08629	439 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	IL18	Q14116	193 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	ZNF181	Q2M3W8	571 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SLC25A35	Q3KQZ1	300 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	PYDC2	Q56P42	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	UBE2NL	Q5JXB2	153 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TRIQK	Q629K1	86 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MTFR2	Q6P444	385 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	TEPP	Q6URK8	271 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	SEM1	Q6ZVN7	128 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	MRGPRG	Q86SM5	289 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	LRRTM1	Q86UE6	522 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CCDC190	Q86UF4	302 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	NAA40	Q86UY6	237 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	CDH26	Q8IXH8	852 aa		4.81	□□□□□ -1.64
ATL1-208	ENST00000556067	C1orf174	Q8IYL3	243 aa		4.81	□□□□□ -1.64

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