RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000028769.12

Ptpra-201, Transcript of Receptor-type tyrosine-protein phosphatase alpha, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ptpra, Length 3,227 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SlbpP97440 275 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 LipnQ3U4B4 400 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fn3krpQ8K274 309 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr998Q8VF76 314 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr836Q8VFJ3 317 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr131Q8VGC8 314 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Wdr13Q91V09 485 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Marveld3Q9D956 376 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 RhcgQ9QXP0 498 aa15.96■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Btbd35f23A0A0R4J2B9 498 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ccdc9bA3KGF9 545 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gprin2D3Z1D7 455 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 H2-T10F6T1I5 379 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GlulP15105 373 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Znf271P15620 580 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 KitlgP20826 273 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc5a12Q49B93 619 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Clns1aQ61189 236 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Nup62Q63850 526 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 CcinQ8CDE2 588 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Tctn3Q8R2Q6 595 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Serpinb1bQ8VHP7 382 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cacng5Q8VHW4 275 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MallQ91X49 154 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SvbpQ99LQ4 66 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MyotQ9JIF9 496 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r103K7N6X7 305 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r122K7N726 305 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r151L7N288 305 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mmp9P41245 730 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ufd1P70362 307 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr140Q60878 302 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Zfp157Q6PCM4 567 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gpr137Q80ZU9 396 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r189Q8K3N3 312 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Adipor1Q91VH1 375 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fbxo15Q9QZN0 433 aa15.95■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sdk2Q6V4S5 2176 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr557E9Q550 322 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Slc6a18O88576 615 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gpr83P30731 423 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mbl2P41317 244 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sirt6P59941 334 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ces2fQ08ED5 561 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm8332Q3UTA4 144 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm7534Q3UU21 679 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ube2j2Q6P073 259 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q8BR90 294 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Apoa5Q8C7G5 368 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Phospho1Q8R2H9 267 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rpusd1Q8VCZ8 306 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr307Q8VFN8 313 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam96bQ9D187 163 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Dpep3Q9DA79 493 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Mrpl39Q9JKF7 336 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Msl3l2G3X992 371 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SryQ05738 395 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Q80UB0 333 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 PhyhipQ8K0S0 330 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Il34Q8R1R4 235 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Olfr584Q8VGW0 319 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ndufb7Q9CR61 137 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r152E9Q9N3 307 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Lipo5F6QKH6 233 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Vmn1r104L7N293 307 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 AhrP30561 848 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gabra1P62812 455 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 9130023H24RikQ8BG98 337 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fbxw19Q8C2W8 466 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ear6Q923L7 155 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 SmpxQ9DC77 85 aa15.94■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 RnlsA7RDN6 342 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Akirin2B1AXD8 201 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 C2cd6E9Q152 557 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 5830473C10RikF8VQ07 620 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm3685J3QPP2 205 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01654 111 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P01656 111 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 P03977 111 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cxcl2P10889 100 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 MyogP12979 224 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ca6P18761 317 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Hrh3P58406 445 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fahd2Q3TC72 313 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ripply3Q924S9 152 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Rgs19Q9CX84 216 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Trappc6bQ9D289 158 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm45716A0A1B0GRQ0 93 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm21818J3KMS6 170 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 GgnQ80WJ1 673 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Fam25cQ8CF02 89 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Sytl3Q99N48 607 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 1700020A23RikQ9DA59 131 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Cmtm2aQ9DAR1 169 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ak3Q9WTP7 227 aa15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Eif3gQ9Z1D1 320 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Ighv15-2A0A0A6YX72 118 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Gm21767J3QPV5 180 aa15.92■□□□□ 0.14
Ptpra-201ENSMUST00000028769 Psmd4O35226 376 aaKnown RBP15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 22.9 ms