Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX72

Ighv15-2, Immunoglobulin heavy variable V15-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ighv15-2A0A0A6YX72 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC31.67■■■□□ 2.66
Ighv15-2A0A0A6YX72 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Ighv15-2A0A0A6YX72 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC30.35■■■□□ 2.45
Ighv15-2A0A0A6YX72 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Ighv15-2A0A0A6YX72 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Ighv15-2A0A0A6YX72 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Ighv15-2A0A0A6YX72 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Ighv15-2A0A0A6YX72 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Ighv15-2A0A0A6YX72 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
Ighv15-2A0A0A6YX72 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Ighv15-2A0A0A6YX72 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Ighv15-2A0A0A6YX72 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Ighv15-2A0A0A6YX72 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Ighv15-2A0A0A6YX72 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Ighv15-2A0A0A6YX72 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Ighv15-2A0A0A6YX72 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Ighv15-2A0A0A6YX72 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ighv15-2A0A0A6YX72 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ighv15-2A0A0A6YX72 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Ighv15-2A0A0A6YX72 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
Ighv15-2A0A0A6YX72 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ighv15-2A0A0A6YX72 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Ighv15-2A0A0A6YX72 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ighv15-2A0A0A6YX72 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ighv15-2A0A0A6YX72 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ighv15-2A0A0A6YX72 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ighv15-2A0A0A6YX72 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ighv15-2A0A0A6YX72 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ighv15-2A0A0A6YX72 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ighv15-2A0A0A6YX72 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ighv15-2A0A0A6YX72 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ighv15-2A0A0A6YX72 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ighv15-2A0A0A6YX72 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ighv15-2A0A0A6YX72 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ighv15-2A0A0A6YX72 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Ighv15-2A0A0A6YX72 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ighv15-2A0A0A6YX72 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ighv15-2A0A0A6YX72 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ighv15-2A0A0A6YX72 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ighv15-2A0A0A6YX72 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ighv15-2A0A0A6YX72 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ighv15-2A0A0A6YX72 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ighv15-2A0A0A6YX72 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ighv15-2A0A0A6YX72 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ighv15-2A0A0A6YX72 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
Ighv15-2A0A0A6YX72 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ighv15-2A0A0A6YX72 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ighv15-2A0A0A6YX72 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ighv15-2A0A0A6YX72 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ighv15-2A0A0A6YX72 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ighv15-2A0A0A6YX72 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ighv15-2A0A0A6YX72 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ighv15-2A0A0A6YX72 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ighv15-2A0A0A6YX72 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighv15-2A0A0A6YX72 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ighv15-2A0A0A6YX72 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Ighv15-2A0A0A6YX72 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ighv15-2A0A0A6YX72 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ighv15-2A0A0A6YX72 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Ighv15-2A0A0A6YX72 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ighv15-2A0A0A6YX72 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ighv15-2A0A0A6YX72 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ighv15-2A0A0A6YX72 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ighv15-2A0A0A6YX72 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ighv15-2A0A0A6YX72 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ighv15-2A0A0A6YX72 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Ighv15-2A0A0A6YX72 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ighv15-2A0A0A6YX72 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ighv15-2A0A0A6YX72 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ighv15-2A0A0A6YX72 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ighv15-2A0A0A6YX72 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ighv15-2A0A0A6YX72 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ighv15-2A0A0A6YX72 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ighv15-2A0A0A6YX72 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ighv15-2A0A0A6YX72 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ighv15-2A0A0A6YX72 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ighv15-2A0A0A6YX72 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ighv15-2A0A0A6YX72 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
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