RNA–Protein interactions for RNA: YOL083W

ATG34, Transcript of Receptor protein involved in selective autophagy during starvation, yeast

Gene ATG34, Length 1,239 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Mitochondria .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
ATG34	YOL083W	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RNR1	P21524	888 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	DID4	P36108	232 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	LYS9	P38999	446 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	GET2	P40056	285 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YNL195C	P40168	261 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	BAP3	P41815	604 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	MTL1	P53214	551 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RNT1	Q02555	471 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YHM2	Q04013	314 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YLR407W	Q06070	228 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	FRE5	Q08908	694 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	HFI1	Q12060	488 aa		4.9	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	TUB2	P02557	457 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	MRC1	P25588	1096 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	SEC65	P29478	273 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	DAL3	P32459	195 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YKU70	P32807	602 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	FAT1	P38225	669 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YBR071W	P38243	211 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	SUL1	P38359	859 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YJL163C	P46996	555 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	BFA1	P47113	574 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	SUN4	P53616	420 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	ADY4	Q05955	493 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	TRE2	Q08693	809 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	ECM3	Q99252	613 aa		4.89	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	PPR1	P07272	904 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	ALG7	P07286	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	BCD1	P38772	366 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	FMO1	P38866	432 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	NIT2	P47016	307 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	NOP9	P47077	666 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	MSE1	P48525	536 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	COX18	P53239	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	COG6	P53959	839 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	CTK1	Q03957	528 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RGC1	Q06108	1083 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	URN1	Q06525	465 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YOL073C	Q08232	322 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	IRC13	Q08630	104 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	PUS9	Q12069	462 aa		4.88	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	CHS7	P38843	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	CCT3	P39077	534 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	FOL1	P53848	824 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YPS7	Q06325	596 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	VPS36	Q06696	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	SGO1	Q08490	590 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RMP1	Q12530	201 aa		4.87	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	GLN4	P13188	809 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	FRS1	P15624	595 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	IME1	P21190	360 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	AEP2	P22136	580 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	PET127	P32606	800 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	SER1	P33330	395 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	NUP60	P39705	539 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	UBC11	P52492	156 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	IOC4	Q04213	475 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	VHS3	Q08438	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	ERG20	P08524	352 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YPT7	P32939	208 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	TOM20	P35180	183 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	FMP52	P40008	231 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	IES1	P43579	692 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	RSC8	P43609	557 aa	Known RBP	4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	THI22	Q06490	572 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	YPR027C	Q12079	277 aa		4.85	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	CDC26	P14724	124 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	PEX1	P24004	1043 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	MVD1	P32377	396 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	HIR1	P32479	840 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	PPS1	P38148	807 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	HRB1	P38922	454 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.84	□□□□□ -1.63	not detected
ATG34	YOL083W	VID28	P40547	921 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	PEX14	P53112	341 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	SKY1	Q03656	742 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	GSF2	Q04697	403 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	STP4	Q07351	490 aa		4.84	□□□□□ -1.63
ATG34	YOL083W	SIR3	P06701	978 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	SEC6	P32844	805 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	TFC4	P33339	1025 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	BIT61	P47041	543 aa		4.83	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PAN2	P53010	1115 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	PLC1	P32383	869 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	BIT2	P38346	545 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	DUN1	P39009	513 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	BUD8	P41698	603 aa		4.82	□□□□□ -1.64
ATG34	YOL083W	SLI1	P53304	468 aa		4.82	□□□□□ -1.64

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