RNA–Protein interactions for RNA: YMR188C

MRPS17, Transcript of Mitochondrial ribosomal protein of the small subunit, yeast

Gene MRPS17, Length 714 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
MRPS17	YMR188C	MRH1	Q12117	320 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	Q0142	Q9ZZW4	58 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	TOP1	P04786	769 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	HCA4	P20448	770 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	AEP2	P22136	580 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	MIH1	P23748	554 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	CCR4	P31384	837 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YBR053C	P38235	358 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	MNN11	P46985	422 aa	Known RBP	5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	BFA1	P47113	574 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	ATG11	Q12527	1178 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	RMP1	Q12530	201 aa		5.01	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YEF3	P16521	1044 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	PLC1	P32383	869 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	DAL3	P32459	195 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	RET2	P43621	546 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	ZIP2	P53061	704 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	LGE1	Q02796	332 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	NRG1	Q03125	231 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	MPD2	Q99316	277 aa		5	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YLR415C	O13578	112 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	KAR1	P11927	433 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	LAT1	P12695	482 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	DID4	P36108	232 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	ENP1	P38333	483 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	SNM1	P40993	198 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	DUG1	P43616	481 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	BNA2	P47125	453 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YHM2	Q04013	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	MUS81	Q04149	632 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	SGO1	Q08490	590 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YLR149C	Q99296	730 aa		4.99	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	HIR1	P32479	840 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	MNN4	P36044	1178 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	SSY5	P47002	699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	MRPS35	P53292	345 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	PTA1	Q01329	785 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	ECM9	Q02202	377 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	THI21	Q08975	551 aa		4.98	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YKR075C	P36155	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	SAK1	P38990	1142 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	PEA2	P40091	420 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	CCT5	P40413	562 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	NIT2	P47016	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	MTR3	P48240	250 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	SPC105	P53148	917 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YNL034W	P53963	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YNL018C	P53976	612 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	SSL2	Q00578	843 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	YOR378W	Q08902	515 aa		4.97	□□□□□ -1.61
MRPS17	YMR188C	DMC1	P25453	334 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	PCL5	P38794	229 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	FMP52	P40008	231 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	GPP2	P40106	250 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YIL166C	P40445	542 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	PCL10	P53124	433 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YAP1802	P53309	568 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YPR027C	Q12079	277 aa		4.96	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	KIN3	P22209	435 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YKR018C	P36114	725 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	MAL31	P38156	614 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	TDP1	P38319	544 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YBR259W	P38338	688 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	BIT2	P38346	545 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	SIC1	P38634	284 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	PFA3	P42836	336 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	VPS73	P53142	486 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	ORC4	P54791	529 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	TGL2	P54857	326 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	GPD1	Q00055	391 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	COQ11	Q05892	277 aa		4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	RPS21B	Q3E754	87 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	TUB1	P09733	447 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	RPS21A	P0C0V8	87 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	SST2	P11972	698 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	SEC65	P29478	273 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	PMC1	P38929	1173 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	ECM1	P39715	212 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	SLD3	P53135	668 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	PHM6	Q05637	104 aa		4.94	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	ATP4	P05626	244 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	PPZ2	P33329	710 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	NIC96	P34077	839 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	HXT6	P39003	570 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	HXT7	P39004	570 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	TAH11	P47112	604 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	TEL2	P53038	688 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	SKY1	Q03656	742 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	IRC13	Q08630	104 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	DCS2	Q12123	353 aa		4.93	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	HIS7	P33734	552 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	OAF3	P36023	863 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YBP2	P53169	641 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	IMO32	P53219	342 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	ARP4	P80428	489 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YNL162W-A	Q3E7A8	72 aa		4.92	□□□□□ -1.62
MRPS17	YMR188C	YKU70	P32807	602 aa		4.91	□□□□□ -1.62

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 93.7 ms