RNA–Protein interactions for RNA: YML038C

YMD8, Transcript of Putative nucleotide sugar transporter, yeast

Gene YMD8, Length 1,329 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMD8	YML038C	YLR419W	Q06698	1435 aa	Known RBP	5.73	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	TAH18	Q12181	623 aa		5.73	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	URB1	P34241	1764 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	VBA3	P25594	458 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	MKK2	P32491	506 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	PRP19	P32523	503 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	ORC2	P32833	620 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	NIP100	P33420	868 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.72	□□□□□ -1.49	not detected
YMD8	YML038C	MAE1	P36013	669 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	VPS41	P38959	992 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	ENV11	P53246	860 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	ZDS2	P54786	942 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	SYF1	Q04048	859 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	TIF35	Q04067	274 aa	Known RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	TDA9	Q04545	1251 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	EST2	Q06163	884 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	YIG1	Q08956	461 aa		5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	SMF3	Q12078	473 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
YMD8	YML038C	CDC48	P25694	835 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	CMK1	P27466	446 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SEG2	P34250	1132 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	UGA2	P38067	497 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RDH54	P38086	958 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	BFR1	P38934	470 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
YMD8	YML038C	CCC2	P38995	1004 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RAD26	P40352	1085 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RNR4	P49723	345 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SHE10	P53075	577 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	ARI1	P53111	347 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	NPL3	Q01560	414 aa	Known RBP RIP-Chip data	5.71	□□□□□ -1.5	not detected
YMD8	YML038C	EIS1	Q05050	843 aa	Known RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	BLS1	Q06071	122 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YDL073W	Q07454	984 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	GAS5	Q08193	484 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YTM1	Q12024	460 aa	Predicted RBP	5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RMP1	Q12530	201 aa		5.71	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	MSS18	P08593	268 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-LR4	P0C2I8	440 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-DR6	P0CX70	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-ER1	P0CX71	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-LR2	P0CX72	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-PL	P0CX73	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-JR1	P0CX74	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-LR3	P0CX75	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-ML2	P0CX76	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SYP1	P25623	870 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	PAH1	P32567	862 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YKL107W	P34251	309 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	MCM7	P38132	845 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YBR284W	P38150	797 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	EXO5	P38289	585 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TIF5	P38431	405 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	NOP16	P40007	231 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RTT105	P40063	208 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	VPS53	P47061	822 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YJR096W	P47137	282 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	HST1	P53685	503 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RAT1	Q02792	1006 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TAF11	Q04226	346 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	MCA1	Q08601	432 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	ELG1	Q12050	791 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-GR1	Q12085	440 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YLL054C	Q12244	843 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RKM4	Q12504	494 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-PR3	Q6Q5H1	440 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-OL	Q92392	440 aa	Known RBP	5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	HBN1	Q96VH4	193 aa		5.7	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	FKS3	Q04952	1785 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	AAC3	P18238	307 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RPC53	P25441	422 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SRO9	P25567	434 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	CNS1	P33313	385 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SIT1	P39980	628 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	PCL7	P40186	285 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	AXL1	P40851	1208 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	QRI7	P43122	407 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	IRC6	P43615	237 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SPO74	P45819	413 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SEC5	P89102	971 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YPL034W	Q03083	165 aa		5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TY1A-NL1	Q12391	440 aa	Known RBP	5.69	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YML133C	Q03099	1374 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YLL067C	Q07888	1374 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YLL066C	Q99208	1374 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	TOP3	P13099	656 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	ERS1	P17261	260 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	REC107	P21651	314 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RPN2	P32565	945 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	RIB7	P33312	244 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	MUD2	P36084	527 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	BYE1	P36106	594 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	YKR075C	P36155	307 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	FTH1	P38310	465 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	OAF1	P39720	1047 aa	Predicted RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	EMP65	P40085	556 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	SLS1	P42900	643 aa		5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	FYV8	P46949	817 aa	Known RBP	5.68	□□□□□ -1.5
YMD8	YML038C	ENT3	P47160	408 aa		5.68	□□□□□ -1.5

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