RNA–Protein interactions for RNA: YJR006W

POL31, Transcript of Subunit of DNA polymerase delta (polymerase III), yeast

Gene POL31, Length 1,464 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
POL31	YJR006W	HIM1	Q06674	414 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	UPC2	Q12151	913 aa		4.92	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	SSK2	P53599	1579 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	BNI1	P41832	1953 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	SEC18	P18759	758 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	PRP4	P20053	465 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	PHO3	P24031	467 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	ETP1	P38748	585 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	ERP2	P39704	215 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	IRC5	P43610	853 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	SET2	P46995	733 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	ASK10	P48361	1146 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	GCV2	P49095	1034 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	MTD1	Q02046	320 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	HLR1	Q04429	423 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	CIA1	Q05583	330 aa		4.91	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	PHO81	P17442	1178 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	HOP1	P20050	605 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	APN2	P38207	520 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	URM1	P40554	99 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	ASI2	P53895	289 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	ORC4	P54791	529 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	RCR2	Q03446	210 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	YMR210W	Q03649	449 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	ROT1	Q03691	256 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	PSR2	Q07949	397 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	YDL177C	Q12257	170 aa		4.9	□□□□□ -1.62
POL31	YJR006W	UFD4	P33202	1483 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	TRP3	P00937	484 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	TUB3	P09734	445 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SED4	P25365	1065 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SSH4	P32343	579 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ATG19	P35193	415 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MSS4	P38994	779 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	PZF1	P39933	429 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ICP55	P40051	511 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	VHR1	P40522	640 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	TEP1	P53916	434 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	COG4	Q06096	861 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	STP4	Q07351	490 aa		4.89	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MYO2	P19524	1574 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	IME1	P21190	360 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SEC21	P32074	935 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	YKR073C	P36153	106 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	DUN1	P39009	513 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SAW1	P39735	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SCS2	P40075	244 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ORC3	P54790	616 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	GTR1	Q00582	310 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ISA1	Q07821	250 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SSP2	Q08646	371 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	CDC25	P04821	1589 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ESC1	Q03661	1658 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	YEL076C-A	P0CX16	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	YLR464W	P0CX17	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	PYC1	P11154	1178 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ADE2	P21264	571 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MSM1	P22438	575 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SRP68	P38687	599 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	STL1	P39932	569 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	YEL076C	P39971	216 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	GID8	P40208	455 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	EXG2	P52911	562 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	PSF3	Q12146	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ARP7	Q12406	477 aa		4.88	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MET5	P47169	1442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ADH4	P10127	382 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	DGR2	P32330	852 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	BEM3	P32873	1128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SIC1	P38634	284 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SPC72	P39723	622 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	YNL195C	P40168	261 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	IMA5	P40884	581 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MET12	P46151	657 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MAD3	P47074	515 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	PUS4	P48567	403 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	PRP31	P49704	494 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	UBA2	P52488	636 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	NCS6	P53088	359 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	TRS130	Q03660	1102 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	VPS36	Q06696	566 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	HMI1	Q12039	706 aa		4.87	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	LTE1	P07866	1435 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	DNF1	P32660	1571 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	RPA190	P10964	1664 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	CDC6	P09119	513 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	ACO1	P19414	778 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.86	□□□□□ -1.63	not detected
POL31	YJR006W	EMC1	P25574	760 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	TGL1	P34163	548 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	SGD1	Q06132	899 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	VHS3	Q08438	674 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MCH5	Q08777	521 aa		4.86	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	YLR415C	O13578	112 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	HIS5	P07172	385 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	MSH1	P25846	959 aa		4.85	□□□□□ -1.63
POL31	YJR006W	APM3	P38153	483 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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