RNA–Protein interactions for RNA: YHR143W-A

RPC10, Transcript of RNA polymerase subunit ABC10-alpha, found in RNA pol I, II, and III, yeastyeast

Gene RPC10, Length 213 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
RPC10YHR143W-A MVD1P32377 396 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A HIR1P32479 840 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A PCL5P38794 229 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A FMO1P38866 432 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A CKB2P38930 258 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A LYS9P38999 446 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A RET2P43621 546 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A BFA1P47113 574 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A DNM1P54861 757 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A SSL2Q00578 843 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A LEE1Q02799 301 aaKnown RBP3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A YKL033W-AQ86ZR7 236 aa3.16□□□□□ -1.9
RPC10YHR143W-A PEX1P24004 1043 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YKR075CP36155 307 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A AKL1P38080 1108 aaKnown RBP3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A TDA3P38758 523 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A BEM4P39011 633 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A GET2P40056 285 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YJR096WP47137 282 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PAN2P53010 1115 aaPredicted RBP3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YGL081WP53156 320 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A COX18P53239 316 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A IRC10Q08118 586 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A NUP145P49687 1317 aa3.15□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ERG20P08524 352 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ERG6P25087 383 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PRP19P32523 503 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A MTH1P35198 433 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A BRN1P38170 754 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SFB3P38810 929 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A CRP1P38845 465 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A QRI1P43123 477 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A NOP9P47077 666 aaKnown RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A FHN1P53279 174 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A GND2P53319 492 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SMX3P54999 86 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A THI22Q06490 572 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A THI73Q07904 523 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A DIA2Q08496 732 aaPredicted RBP3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ECM3Q99252 613 aa3.14□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A CDC43P18898 376 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SSD1P24276 1250 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91not detected
RPC10YHR143W-A PHO11P35842 467 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SPC42P36094 363 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A TYS1P36421 394 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A CBR1P38626 284 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PHO12P38693 467 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YHR202WP38887 602 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A HRB1P38922 454 aaKnown RBP RIP-Chip data3.13□□□□□ -1.91not detected
RPC10YHR143W-A NUG1P40010 520 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PIG2P40187 538 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ARG2P40360 574 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A GZF3P42944 551 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A RSC8P43609 557 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YGR153WP48238 217 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YNR029CP53729 429 aaKnown RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A UME1Q03010 460 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A MTQ2Q03920 221 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ISA1Q07821 250 aaPredicted RBP3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A TAD3Q9URQ3 322 aa3.13□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PRP28P23394 588 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A DMC1P25453 334 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PET127P32606 800 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A BIT2P38346 545 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A CCT5P40413 562 aaKnown RBP3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A NDC80P40460 691 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YMR210WQ03649 449 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A VHS3Q08438 674 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A MRH1Q12117 320 aaPredicted RBP3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ZRT2Q12436 422 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A POM34Q12445 299 aa3.12□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SWI6P09959 803 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A GFA1P14742 717 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A FRS1P15624 595 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A THR1P17423 357 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A KIN3P22209 435 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A KIN82P25341 720 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A IMG2P25642 146 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YKU70P32807 602 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SEC6P32844 805 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A BDH2P39713 417 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YNL195CP40168 261 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ATG4P53867 494 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A HFD1Q04458 532 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A VBA4Q04602 768 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YLR407WQ06070 228 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A VPS36Q06696 566 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YTM1Q12024 460 aaPredicted RBP3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A APM4Q99186 491 aa3.11□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A ABF1P14164 731 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A HCA4P20448 770 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A SEC15P22224 910 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A PRP22P24384 1145 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A BCS1P32839 456 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YPT7P32939 208 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A DID4P36108 232 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YJL206CP39529 758 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A MNN11P46985 422 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A BIT61P47041 543 aa3.1□□□□□ -1.91
RPC10YHR143W-A YGR237CP50089 785 aa3.1□□□□□ -1.91
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